Reposted by 奥山雄大ver.欲深Maddy Seale @maddyseale.bsky.social · 02/01/2026Large scale genomic analysis also feeds into our papers on plant evolution and inheritance with papers on epigenetic inheritance, the evolution of metabolic enzymes in carrion-mimicking plants, speciation and reproductive isolation in plants, as well as climate adaptation of alpine plants (17/22): 131
Reposted by 奥山雄大ver.欲深Maddy Seale @maddyseale.bsky.social · 02/01/2026Continuing in the genetics world, research on crop genetics and domestication continues to provide insight, with investigations of chromatin accessibility in maize, variation in seed dormancy traits in barley, and exploration of domestication and diversity in adzuki bean and manioc genomes (15/22): 111
Reposted by 奥山雄大ver.欲深Maddy Seale @maddyseale.bsky.social · 02/01/2026At the end of 2024 I did a chronological round up of all the #plantscience in @science.org that year. So how did 2025 pan out? This year, I’m grouping papers thematically instead of chronologically so read on to find out what exciting plant science came out over the last 12 months. (1/22) 37436
Reposted by 奥山雄大ver.欲深kazy @gakeau.bsky.social · 07/12/2025鳥羽旅行。鳥羽のいいお宿に泊まったら部屋に古事記全訳英訳付きがおいてあって「さすがお伊勢…誰が訳したんだろう…」と思って見てみたら古事記普及委員会 竹田恒泰訳」とあって一気にこれはあかんやつやとなった。こんなとこで金稼いどるんやなあ。 089
Reposted by 奥山雄大ver.欲深ICAN Japanese @nuclearban-jp.bsky.social · 18/11/2025「人類史上初の原爆、被爆の惨禍を経験した場所として、非核三原則は絶対に守るべきものだ」 「抑止は否定するものではないが、そこに『核』という要素が入るとリスクが高くなることを政府は認識し、核抑止から脱却する方策に全力を注いでほしい」 広島県知事、非核三原則「絶対守るべき」 高市政権の見直し論受け|毎日新聞 mainichi.jp/articles/202...mainichi.jp広島県知事、非核三原則「絶対守るべき」 高市政権の見直し論受け | 毎日新聞核兵器を「持たず、作らず、持ち込ませず」の非核三原則のうち「持ち込ませず」について高市早苗首相が与党内で見直し議論を開始させる検討に入ったことに対し、広島県の湯崎英彦知事は18日の定例記者会見で「報道ベースのため現時点で予断は控える」とした上で、「人類史上初の原爆、被爆の惨禍を経験した場所として、 03636
Reposted by 奥山雄大ver.欲深ごとうなな @nijinana.bsky.social · 24/06/2025ウナギいきのこりすごろくは、初めて手元にいるウナギ数十匹が、すごろくを進めていくうちに悉く減っていくのを体験するゲーム。 ウナギが置かれている過酷な環境や、人的影響を可視化して、子どもも大人も体感的に学べるゲームです。おすすめ。 www.nacsj.or.jp/unagi_game/nacsj.or.jpウナギいきのこりすごろく日本自然保護協会・中央大学で開発した、遊んで学べるニホンウナギのすごろくについてご紹介します。 05955
Reposted by 奥山雄大ver.欲深Société Botanique de France @societebotaniquedefrance.fr · 06/06/2025Pour en savoir plus sur les mécanismes évolutifs à l’origine de ce mimétisme olfactif : - L’article d’origine dans @science.org : www.science.org/doi/10.1126/... - Une synthèse vulgarisée (mais en anglais) de l’article : pure.mpg.de/rest/items/i...science.orgConvergent acquisition of disulfide-forming enzymes in malodorous flowersIdentifying the metabolic and genetic changes that confer evolutionary novelty is essential for understanding the factors facilitating or constraining the occurrence of traits. We show that dimethyl d... 112
Reposted by 奥山雄大ver.欲深Société Botanique de France @societebotaniquedefrance.fr · 06/06/2025Chez certaines plantes à l’odeur de charogne, le gène de l’enzyme découpant le méthanethiol a été dupliqué et quelques mutations d’une des copies ont suffi à lui faire fabriquer une assembleuse de méthanethiol, produisant d’autres molécules odorantes. C’est un bel exemple de néofonctionnalisation ! 112
Reposted by 奥山雄大ver.欲深Société Botanique de France @societebotaniquedefrance.fr · 06/06/2025Or, quand un gène existe en plusieurs exemplaires dans le génome, certaines versions peuvent évoluer en accumulant des mutations sans que cela pose de problème, tant qu’une des copies reste capable de remplir la fonction initiale. 112
Reposted by 奥山雄大ver.欲深Société Botanique de France @societebotaniquedefrance.fr · 06/06/2025Cette innovation a pu émerger grâce à la duplication d’un gène. Différents mécanismes moléculaires peuvent être à l’origine de ce phénomène classique de l’évolution, qui consiste en l’apparition d’un voire plusieurs nouveaux exemplaires d’un gène dans le génome, copies de la version initiale. 112
Reposted by 奥山雄大ver.欲深Société Botanique de France @societebotaniquedefrance.fr · 06/06/2025Les molécules odorantes sont produites par l’assemblage de plusieurs molécules de méthanethiol, par des enzymes dérivées de celles qui dégradent normalement ce composé. Des ciseaux moléculaires ont été transformés en scotch… par seulement deux ou trois mutations dans le gène correspondant ! 112
Reposted by 奥山雄大ver.欲深Société Botanique de France @societebotaniquedefrance.fr · 06/06/2025Une équipe japonaise a récemment identifié l’enzyme responsable de la production des composés soufrés qui donnent leur parfum de charogne à certaines fleurs, notamment celles des plantes du genre Asarum. Et cette enzyme est très proche d’une protéine à la fonction opposée. 112
Reposted by 奥山雄大ver.欲深Société Botanique de France @societebotaniquedefrance.fr · 06/06/2025Pour attirer leurs pollinisateurs, certaines plantes à fleurs emploient une technique radicale : émettre un parfum de charogne. Croyant repérer un alléchant cadavre, des insectes explorent les fleurs et repartent chargés de pollen. Mais comment s’y prennent les plantes pour avoir cette odeur ? 🤔 152
Reposted by 奥山雄大ver.欲深windowmoon@bluesky @windowmoon.bsky.social · 30/05/2025旧帝の学生のコンサル行きは本当に増えてますね。他業種に比べると虚業度合いは高い印象を持っている。コンサルは必要だろうけど、そこばかり栄えるのはだいぶまずい気がします。 023
Reposted by 奥山雄大ver.欲深Maddy Seale @maddyseale.bsky.social · 30/05/2025The domestication of adzuki beans. #PlantScience in this week's @science.org magazine. www.science.org/doi/10.1126/...science.orgA single domestication origin of adzuki bean in Japan and the evolution of domestication genesAdzuki is a central legume in East Asian culinary culture, yet its domestication origin remains debated. Using ~700 accessions across Asia, we show that the initial domestication happened three to fiv... 0114
奥山雄大ver.欲深 @yokubukayama.bsky.social · 29/05/2025切ない、、、。昔飼育してたけど、素晴らしい動物なんですが。アジアにはいないタイプの樹上性の植食性爬虫類という特殊なニッチ。ニホンザルとかと競合しそう。 100
奥山雄大ver.欲深 @yokubukayama.bsky.social · 28/05/2025カンアオイの臭い花進化研究、朝日新聞にも記事にして頂きました。生き物の話題では定評のある矢田さんに執筆して頂きました!5月29日 17:18まで全文お読みいただけます。 digital.asahi.com/sp/articles/...digital.asahi.comくさい花をくさくする遺伝子解明 「日本の植物園だからできた」研究:朝日新聞腐敗臭などを放つ「くさい花」は、どうやって強烈なにおいを生み出しているのか――。国立科学博物館などのチームが、その秘密に迫る成果をまとめた。米科学誌サイエンスに報告した(https://doi.or… 094
Reposted by 奥山雄大ver.欲深Takehiko MAKINO @takehikom.bsky.social · 23/05/2025「長年にわたって、保守派が高等教育機関のエリート層に抱いてきた不信感」があるとしても、トランプは単に、自分に跪くことを拒否する相手を徹底的に潰そうとしているだけなのだと思う。こういう具体的な手口を自分一人で思いつくとは思えないので誰か入れ知恵している人間がいるのだろうけど、ここまで来ると、実はアメリカを潰すために送り込まれた諜報員だと言われても驚かないなあ。 001
Reposted by 奥山雄大ver.欲深Takehiko MAKINO @takehikom.bsky.social · 23/05/2025www.nhk.jp/p/catchsekai... アメリカの自己破壊行為というだけにとどまらないでしょう。アメリカからの頭脳流出で研究者の移動が起こる中では、科学や技術の成果が出るペースも落ちざるを得ない。これは世界的な損失で、移動の結果として新たに最適化された分布になるまではそれが続くだろう。しかもその結果がアメリカに研究者が集まるこれまでの体制よりも優れたものになるのかどうかも分からない。 > イギリスの経済紙エコノミストは「MAGA、つまりトランプ政権の科学への攻撃は重大な自己破壊行為だ」と指摘。nhk.jp【解説】米トランプ政権vs名門大学 対立激化の行方は - キャッチ!世界のトップニュース米トランプ政権は、 ハーバード大学に対して留学生を受け入れる機関としての認定を取り消すと発表。経緯や背景を横川浩士キャスターが解説。 11512
Reposted by 奥山雄大ver.欲深吉澤和徳 @psocodea.bsky.social · 23/05/2025Mesquite4 beta www.mesquiteproject.orgmesquiteproject.orgMesquite Project 013
Reposted by 奥山雄大ver.欲深Kensuke Nakata @cyclosa.bsky.social · 21/05/2025生き物を舐めてかかるから。メディア使った操作は効かないよ。 news.yahoo.co.jp/articles/e70...news.yahoo.co.jp大屋根リングの柱にびっしり...万博で「ユスリカ」大量発生 運営は殺虫剤などで対策、専門業者へ相談も(J-CASTニュース) - Yahoo!ニュース大阪・関西万博で、虫が大量発生しているとしてXで複数投稿され、注目を集めている。特に海辺に位置する「ウォータープラザ」周辺で発生しているようで、大屋根リングの柱に大量の蚊のような虫がついている写真 02411
Reposted by 奥山雄大ver.欲深Yasuhiro (Yasu) Sato @yassato.bsky.social · 19/05/2025Awesome work including natural history, chemical ecology, plant-pollinator interactions, and many other aspects. Must-read! 101
奥山雄大ver.欲深 @yokubukayama.bsky.social · 19/05/2025This paper, which was fortunately published in Science, is the fruits of more than 20 years of my scholarly pursuit in biology, and I believe that I have finally achieved one of the milestones, which I had envisioned in my mind, of my research. Below I would like to tell the story behind it.science.org 1106
Reposted by 奥山雄大ver.欲深Oca sapiens @ocasapiens.bsky.social · 09/05/2025the news by @heidiledford.bsky.social is. Incipit: "With a nickname like ‘skunk cabbage’, the infamously stinky flowers of Symplocarpus renifolius are unlikely to grace a bridal bouquet." See also www.theguardian.com/environment/...nature.comHow skunk cabbages and other smelly plants brew their foul odourA small tweak to a common enzyme gives plants the ability to make smelly sulfurous molecules. 011
Reposted by 奥山雄大ver.欲深Oca sapiens @ocasapiens.bsky.social · 09/05/2025#genetics #enzymes #coevolution A large part of @science.org reports on the US government's destruction of US science. So it's a pity the story of how Aristolochiaceae and two other plant genera evolved disulfide synthase to attract specific pollinators to their stinky flowers isn't OA. But 1/2science.orgConvergent acquisition of disulfide-forming enzymes in malodorous flowersIdentifying the metabolic and genetic changes that confer evolutionary novelty is essential for understanding the factors facilitating or constraining the occurrence of traits. We show that dimethyl d... 111
奥山雄大ver.欲深 @yokubukayama.bsky.social · 08/05/2025というわけで論文出ました。サイエンス誌のトップページをトクノシマカンアオイとその送粉者の写真が飾っています。ちょっと自分でも信じられないです。 www.science.orgscience.orgScience | AAASScience/AAAS peer-reviewed journals deliver impactful research, daily news, expert commentary, and career resources. 22910
奥山雄大ver.欲深 @yokubukayama.bsky.social · 07/05/2025明日未明についに、これまでの研究人生のひとつの集大成と言える論文が出ます。プレスリリースはちょっと遅れていて本日午後に記者会に投げ込み予定です。なのにすでに海外4社、国内2社から取材依頼が来ていて、反響の大きさに驚いています。 060
奥山雄大ver.欲深 @yokubukayama.bsky.social · 04/05/2025日本自然保護協会の会報、自然保護の最新号にインタビュー形式の記事を掲載して頂きました。花と昆虫の関係が分かりやすく包括的に紹介されており大変いい記事と思います。師匠の加藤真先生の論説も一緒に掲載されており光栄です。全国の自然保護の担い手に読まれてるだけあり、毎号読み応えあります! 052
Reposted by 奥山雄大ver.欲深Daisuke Akaishi @daicha5.bsky.social · 16/04/2025大学教員が左寄りでなくてどうすると思うがな。世の中の矛盾を見過ごさず、空気を読まず、世の中わかってないと笑われながら青臭い正論吐いてなんぼだろ。 17623
Reposted by 奥山雄大ver.欲深Dr. RawheaD @rawhead.bsky.social · 19/03/2025アメリカで開催される学会に出席するために渡米したフランス人科学者が、チャットのメッセージでトランプ政権の政策を批判してるのが入国管理官の目にとまり入国拒否された、という、もう完全にイっちゃってる出来事が既に起きているンですよ。 2324260
Reposted by 奥山雄大ver.欲深Kensuke Nakata @cyclosa.bsky.social · 18/03/2025学会が終わってアメリカの状況を見て、私たちが踊っている基盤の脆弱さという現実に引き戻される。 というか、学会で発表を聞いている時も、なんかこれは砂上の楼閣では?という感覚がわずかにあった。これまでなかったことだ。 0102
Reposted by 奥山雄大ver.欲深Takefumi Nakazawa @takefuminakazawa.bsky.social · 18/03/2025他人がとってくれた記録をまとめてマクロエコロジーだ高IFだウェーイとかかっこいいことだけ言ってないで、自分たちできちんと泥臭い記録を残しましょう。 #esj72 1136
奥山雄大ver.欲深 @yokubukayama.bsky.social · 19/03/2025というわけで、最近ちょっとずつ読み進めている。まだファーブルの半生を描いた半分ほどまでしか読んでないけれどこれは本当に名著で、多くの人に読んで欲しい。自然科学者はかくありたし、とあらためて思います。 本書、著者のルグロ博士がいかにファーブルに心酔していたかも分かるのが本当に良い。ルグロ博士の尽力がなければ、遠く極東のこの地までファーブルの偉業は伝わらなかっただろうし、多くのファーブルに魅せられた日本の自然科学者は育たなかっただろう。僕もその端くれです。 000
奥山雄大ver.欲深 @yokubukayama.bsky.social · 19/03/2025生態学会からの帰りです。昨晩はかめふじ氏の素晴らしい講演を聴いたのち、自然保護専門委員会のコアメンバーと懇談会でした。最近自分の研究は分子生物学寄りになっていますが、本来の目的は生き物の実際を遺伝子レベルまで見通した上でマクロに理解すること、という初心をあらためて思い出しました。 最近ファーブル伝も読みあらためて肝に銘じているのですが、概念は概念に過ぎず、現象を泥臭く見ることでしか生き物の実態には迫れない、と思います。フィールドでの観察、実験ベースの生態学こそが王道です。そして、生き物が実際に息づくフィールドそのものを守らなければ生物学の未来はありません。 051
Reposted by 奥山雄大ver.欲深sakumad2003 @sakumad2003.bsky.social · 18/03/2025#ESJ72S16 「先端技術が切り拓く植物―動物―気候フィードバック研究の最前線」に異動。花の香りと送粉者の関係を下にした種分化の研究は、生態だけでなく、化学物質をつくる機構が遺伝子に結びついてるので、遺伝的解析に着実にいけるので有利と奥山さん。なるほどねぇ。 131
奥山雄大ver.欲深 @yokubukayama.bsky.social · 18/03/2025生態学会シンポ、「先端技術が切り拓く植物―動物―気候フィードバック研究の最前線」で無事発表を終えて、自然保護専門委員会のフォーラムに参加してようやくお昼です。ご来聴の皆さまありがとうございました。最後らへんのカンアオイの話は、今日話さなかった内容も含めて4月にたぶん出版になると思います。あそこからさらに驚きの展開があるのでご期待下さい。 021
Reposted by 奥山雄大ver.欲深Ecological Research @ecologicalresearch.bsky.social · 15/03/2025We were honored to celebrate with our Awardees at the ceremony. Congratulations to all!👏 From left to right: Hiroshi Tomimatsu (EiC of Ecological Research @hrstm.bsky.social ), Kohmei Kadowaki, Naoyuki Nakahama @naoyukinkhm.bsky.social, Samuel R. P.-J. Ross #ESJ72 #ERPaperAward 01510
奥山雄大ver.欲深 @yokubukayama.bsky.social · 09/03/20257kmランニング出勤。昨年9月末あたりから習慣化しているランニングが、いつしか論文がうまくいく願掛けのようになっていて、実際に論文がうまくいったのでもはや幸福のためのジンクスのようになっている。 000
Reposted by 奥山雄大ver.欲深Sayaka Oki おきさやか @okisayaka.bsky.social · 08/03/2025学術会議法人化案、想像以上にまずい。アカデミーなのに戦前の軍事兵器開発者向けみたいな文言が! 第三四条「会議の役員、役員以外の会員及び職員は、職務上知ることのできた秘密を漏らしてはならない。その職を退いた後も、同様とする」 通常、職を退いた後も縛るのはあり得ない! しかも第五五条によると、違反者は一年以下の拘禁および50万以下の罰金、らしい。普通こんなのは政府が機密事項に関する法律を定めて運用すべきことで、アカデミーの会則に入れるのはおかしい。軍事との関係が強めな米国科学アカデミーの規定すらそのように運用している。 www.cao.go.jp/houan/pdf/21...cao.go.jp 4390308
奥山雄大ver.欲深 @yokubukayama.bsky.social · 05/03/2025研究人生20年余りの集大成と言える大論文がアクセプトされて超ハッピーな朝です。研究成果を世界に共有できるのが楽しみです。4月中には公開になるのではないかと思います。 081
奥山雄大ver.欲深 @yokubukayama.bsky.social · 16/02/2025僕はスターリンクが星空を汚してるという話を知ってから、マスクは知を愛する人物ではないと認識しました。あっという間に反知性のアイコンみたいになりましたね。 041
Reposted by 奥山雄大ver.欲深星 暁雄 (Akio Hoshi) @akiohoshi.bsky.social · 08/02/2025私の意見では、英語圏のテック・ブロ(テック野郎)たちには思想上の脆弱性があり、そこを突かれて怪しい信念体系に占拠されてしまったのである 残念なことに、英語圏では大陸ヨーロッパの倫理学(特にカント)が不人気である。人権のアイデアも、英語圏の哲学者の間では不人気である(ロールズでさえ人権のアイデアをうまく咀嚼できていない)。 21世紀に入り、国連機関や世界経済フォーラムやEUらが到達した「人権、倫理を基盤に企業と社会を協調させていく」という思想は、英語圏の経営者らからは奇異に、空想的に見えてしまった。 これは悲劇的なすれ違いだと考えている。 112039
Reposted by 奥山雄大ver.欲深星 暁雄 (Akio Hoshi) @akiohoshi.bsky.social · 08/02/2025追記: ビッグテック経営者はもとより、いわゆる「テック・ブロ」と呼ばれる人々は、「技術とスタートアップ経営を身につけた自分たちは一般人よりもよく分かっている」という意識を持っている。どの分野でも、専門家とはそのような考え方をするだろう。 問題は、その信念を専門外の分野に向けてしまうことだ。 このような思考のバグを付いて、新反動主義、加速主義、「暗黒啓蒙」などと呼ばれる怪しい信念体系が広がった。ピーター・ティールやマーク・アンドリーセンはこうした怪しい信念体系を信奉しているし、イーロン・マスクも同類である。 (続く 110333
Reposted by 奥山雄大ver.欲深星 暁雄 (Akio Hoshi) @akiohoshi.bsky.social · 07/02/2025私の個人的な意見では、デジタルテクノロジー業界は、製鉄、建設、自動車、航空機、電機といったより古い業界のように、社会と協調した穏やかな成長を目指す段階に入った。検索エンジンもSNSもネット広告も、人々を害さないような形により洗練させ、穏やかに成長できる余地はあるはずである。例えばEUの法規制はそれを求める内容だ。 だがビッグテック経営者たちは、こうした考え方を拒否する。 いままでさんざん持ち上げられてきたので、新しい思考を受け入れられないのだ。「自分たちのビジネスが人々を害している」という批判を受け入れられない。 この構図をまず認識すること。認識を共有すること。それが私の当面の目標だ。 224878
Reposted by 奥山雄大ver.欲深星 暁雄 (Akio Hoshi) @akiohoshi.bsky.social · 07/02/2025ここから先は、あまり楽しくない世界になる。 まず「技術が世界を変える」楽観論が通用しなくなる。理由は、ムーアの法則の減速、インターネット普及率向上、ビッグテックのシェアの大きさ。じっさい、GoogleやFacebookの後で彼らを越えるテック企業は登場していない。 テック企業経営者たちも「思うようにいかない」と感じているはずである。ザッカーバーグは次の一手を求めて決済、VR、AIと巨額投資を繰り返す。ビッグテック各社がAIデータセンターに巨額投資をするのは、他に急成長のネタが見つからないからだ。だがリターンは不確実である。 世界はすでに減速している。彼らはそのことを認めたくない。 315050