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IFB/ELIXIR-Fr

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Institut Français de Bioinformatique (IFB) et noeud français d'ELIXIR Europe IFB is the national #bioinformatics infrastructure for #lifesciences communities and the French node of @elixir-europe.org 💻 www.ifb-elixir.fr

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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 02/10/2026
🧬 Le projet #ABRomics, co-porté par l’IFB et l'Institut Pasteur, est soutenu par le PPR #Antibioresistance, piloté par l'Inserm, dans le cadre du plan d’investissement de l’État français, #France2030. #ABRomics @cnrsbiologie.bsky.social @pasteur.fr @inserm.fr @inrae-france.bsky.social
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 02/10/2026
Pour découvrir l’ensemble des nouveautés 👉 www.abromics.fr/1-6-0-the-ab... N'hésitez pas à vous inscrire, à tester et à explorer cette nouvelle version de la plateforme ABRomics et à envoyer vos commentaires à notre équipe d'assistance : analysis.abromics.fr/contactus
abromics.fr
1.6.0: The ABRomics platform has been updated! – ABRomics website
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 02/10/2026
✨ Modifications Responsive design des entêtes des pages d’accueil ; … 🚀 Ajouts Nouveau tableau de bord pour les visualisations cMLST ; possibilité de filtrer par workflow dans un projet ; … 🛠 Corrections - Problème en essayant de supprimer son ORCID dans la page Profile ; …
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 02/10/2026
Une nouvelle version de la plateforme #ABRomics est disponible ! Déployée ce 1er octobre, nous sommes heureux d'annoncer la sortie de la version 1.6.0 de la plateforme d'analyse ABRomics. De nombreuses nouvelles fonctionnalités sont à découvrir et explorer, telles que 👇
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 29/09/2026
@cnrs-idf-villejuif.bsky.social @helenechiapello.bsky.social @mthomaschollier.bsky.social @nlitb.bsky.social @fred2l.bsky.social @julozi.bsky.social @cnrsbiologie.bsky.social @ibisa.net @inserm.fr @inrae-france.bsky.social @jebif.bsky.social @pasteur.fr @recherchedatagouv.bsky.social
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 29/09/2026
Vous souhaitez la lire et/ou vous abonner ? C’est possible depuis le site internet de l’IFB 👇 www.ifb-elixir.fr/newsletter/
ifb-elixir.fr
Newsletter - IFB | ELIXIR-FR
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 29/09/2026
📢 📰 Le dernier numéro des News de l’IFB/ELIXIR-FR est paru ! 🔎 Au programme : All-hands IFB ; une nouvelle collection HAL pour l’infra (🙏 @cnrs-inist.bsky.social ) ; actualités des plateformes IFB, ELIXIR France ; formations ; dernières publications IFB/ELIXIR-FR ; …
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 28/09/2026
@cnrs-idf-villejuif.bsky.social @helenechiapello.bsky.social @mthomaschollier.bsky.social @nlitb.bsky.social @fred2l.bsky.social @julozi.bsky.social @cnrsbiologie.bsky.social @ibisa.net @inserm.fr @inrae-france.bsky.social @jebif.bsky.social @pasteur.fr @recherchedatagouv.bsky.social
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 28/09/2026
👉 Des questions sur ces nouveautés ? On est disponibles pour en discuter sur Tchap ! www.ifb-elixir.fr/outils-servi... Vous trouverez aussi tous les détails de cette nouvelle version sur GitLab : gitlab.com/ifb-elixirfr...
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 28/09/2026
🎉 Des nouveautés : Sélection multiple plus lisible ; Profil enrichi ; etc... ⚡ et bon nombre d'améliorations !
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 28/09/2026
📢 Mise en production de madbot Euriphene Déployée ce 23 septembre 2026, une nouvelle version de #madbotByIFB est disponible ! Nous sommes ravis de partager cette nouvelle version, qui apporte de nouvelles fonctionnalités et des améliorations de l'expérience utilisateur.
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 22/09/2026
🧬 Le projet ABRomics, co-porté par l’IFB et l'Institut Pasteur, est soutenu par le PPR #Antibioresistance, piloté par l'Inserm, dans le cadre du plan d’investissement de l’État français, #France2030. #ABRomics @cnrs.fr @cnrsbiologie.bsky.social @pasteur.fr @inserm.fr @inrae-france.bsky.social
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 22/09/2026
Philippe Glaser a présenté la plateforme ABRomics puis a répondu lors d’une session de questions-réponses : “ABRomics, une plateforme omique pour la surveillance et la recherche en antibiorésistance.” Plus d’informations 👉 www.abromics.fr/abromics-pre...
abromics.fr
ABRomics presented during REMIC’S webinar – ABRomics website
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 22/09/2026
Le 17 septembre, Philippe Glaser, Co-Responsable de la Plateforme #ABRomics a participé au webinaire hebdomadaire REMIC’S organisé par la Société Française de Microbiologie.
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 21/09/2026
📢 🌟 IFB/ELIXIR-FR contributed to this milestone in the HARVEST project as a member and co-coordinator of the project!
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 21/09/2026
@cnrs-idf-villejuif.bsky.social @helenechiapello.bsky.social @mthomaschollier.bsky.social @nlitb.bsky.social @fred2l.bsky.social @julozi.bsky.social @cnrsbiologie.bsky.social @ibisa.net @inserm.fr @inrae-france.bsky.social @jebif.bsky.social @cnrs.fr @pasteur.fr @recherchedatagouv.bsky.social
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 21/09/2026
🧬​​ Le projet #ABRomics, co-porté par l’IFB et l’Institut Pasteur, est soutenu par le PPRA | Interface nationale Antibiorésistance, piloté par l’Inserm, dans le cadre du plan d’investissement de l’État français, France 2030. #Antibioresistance #AntiomicrobialResistance #OneHealth #PPRA #France2030
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 21/09/2026
💡 Cette newsletter a pour objectif de diffuser encore plus largement les avancées du projet, les actualités scientifiques et de contribuer au partage des connaissances autour de cette problématique majeure. Pour découvrir ce 4e numéro et vous inscrire aux prochains : www.abromics.fr/newsletter/
abromics.fr
Newsletter – ABRomics website
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 21/09/2026
📢 Le quatrième numéro de la newsletter externe ABRomics est disponible ! 🦠 Au programme de ce nouveau numéro : ABRomics à ECCB 2026, une nouvelle version de la plateforme, un connecteur ABRomics en cours de développement sur madbot…
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 21/09/2026
🌟 Les visites ont été nombreuses, y compris pendant la pause déjeuner, ce qui témoigne de l’intérêt de la communauté pour les fonctionnalités originales offertes aujourd’hui par la PF ABRomics ! Pour en savoir plus 👉 www.abromics.fr/abromics-at-...
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 21/09/2026
🔎 L’ensemble des fonctionnalités de la plateforme ABRomics dans sa version génomique a été présenté dans un poster lors de la session du mercredi matin : “ABRomics: a platform for antibiotic resistance research and public health using an integrated ‘one Health’ approach”. (hal.science/hal-05732017)
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 21/09/2026
Le programme scientifique était organisé autour du thème « Biodiversité, IA et santé : la biologie computationnelle au service des défis de notre époque » et a rassemblé près de 1 500 scientifiques.
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 21/09/2026
📢 Du 31 Août au 04 Septembre 2026, Julie Lao (IR sur la PF ABRomics) et Claudine Médigue (co PI ABRomics) étaient à Genève pour participer à la 25e édition de la conférence Européenne annuelle de bioinformatique ECCB (eccb2026.org), organisée par le SIB (Swiss Institute of Bioinformatics).
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 17/09/2026
Check out this presentation by @bebatut.bsky.social , ELIXIR-France (IFB/ELIXIR-FR) co-lead for the FAIRyMAGs project! 🙏
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Reposted by IFB/ELIXIR-Fr
ELIXIR Europe @elixir-europe.org · 14/09/2026
The ELIXIR-funded FAIRyMAGs project has released a set of 🙌 openly available workflows, training materials and example #datasets to support researchers working with metagenome-assembled genomes 👉 loom.ly/yh_aNFE @ifb-elixir-fr.bsky.social @ebi.embl.org @denbi.bsky.social @elixir-it.bsky.social
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 07/09/2026
@cnrs-idf-villejuif.bsky.social @helenechiapello.bsky.social @mthomaschollier.bsky.social @nlitb.bsky.social @fred2l.bsky.social @julozi.bsky.social @cnrsbiologie.bsky.social @inserm.fr @inrae-france.bsky.social @jebif.bsky.social @cnrs.fr @pasteur.fr @recherchedatagouv.bsky.social
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 07/09/2026
🚨📢🖥 IDRIS Server Maintenance - From September 14 to 21, 2026, the IFB’s tools and websites (the IFB website, the ABRomics website, DSW, Fair-checker, OnDemand, etc.) will be unavailable due to a server outage for maintenance. Thank you for your understanding ✨ #data #bioinformatique #cluster #cloud
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 07/09/2026
🚨📢🖥 Maintenance des serveurs IDRIS - Du 14 au 21 septembre 2026, les outils et sites web de l’IFB (site web de l’IFB, site web d'ABRomics, DSW, Fair-checker, OnDemand, etc.) seront indisponibles en raison d’une coupure des serveurs pour maintenance. Merci pour votre compréhension ✨
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 04/09/2026
www.ifb-elixir.fr/generale/img...
ifb-elixir.fr
IMGT rejoint le Core Data Ressources ELIXIR grâce à ses données scientifiques sous licence libre - IFB | ELIXIR-FR
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 03/09/2026
🙏 Thanks for including #IMGT in the @elixir-europe.org Core Data Resources, an ELIXIR France (@ifb-elixir-fr.bsky.social ) resource established and managed by the Institut de Génétique Humaine (UMR 9002 CNRS - Univ. Montpellier) and the @cnrsbiologie.bsky.social ! 👏
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 03/09/2026
Thank you to everyone who took part in the @elixir-europe.org FAIR metadata workshop, which was co-organised by Hervé Menager!
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 02/09/2026
📣 Plus que 3 jours pour vous inscrire à la formation "Alphafold et audelà" qui se déroulera en janvier 2027 à Orsay !👇 moodle.france-bioinformatique.fr/course/view....
moodle.france-bioinformatique.fr
Cours : AlphaFold et au-delà 2027 - Modélisation de la structure 3D des protéines avec des outils d’IA / AlphaFold & beyond 2027 - 3D Protein Structure Modeling with AI Tools | IFB formation
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 04/08/2026
🧬 Le projet ABRomics, co-porté par l’IFB et l'Institut Pasteur, est soutenu par le PPR #Antibioresistance, piloté par l'Inserm, dans le cadre du plan d’investissement de l’État français, #France2030. #ABRomics @cnrs.fr @cnrsbiologie.bsky.social @pasteur.fr @inserm.fr @inrae-france.bsky.social
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 04/08/2026
Pour découvrir l’ensemble des nouveautés 👉 www.abromics.fr/1-5-0-the-ab... N'hésitez pas à vous inscrire, à tester et à explorer cette nouvelle version de la plateforme ABRomics et à envoyer vos commentaires à notre équipe d'assistance : analysis.abromics.fr/contactus
abromics.fr
1.5.0: The ABRomics platform has been updated! – ABRomics website
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 04/08/2026
✨ Modifications Enrichissement des résultats relatifs aux gènes de résistance aux antimicrobiens (AMR), messages d’erreur plus explicites ; … 🚀 Ajouts Nouveau type d’échantillon, possibilité de s’abonner à la newsletter à la création du compte ; … 🛠 Corrections Mise à jour du format ORCID
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 04/08/2026
Une nouvelle version de la plateforme #ABRomics est disponible ! Déployée ce 24 juillet, nous sommes heureux d'annoncer la sortie de la version 1.5.0 de la plateforme d'analyse ABRomics. De nombreuses nouvelles fonctionnalités sont à découvrir et explorer, telles que 👇
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 24/07/2026
@cnrs-idf-villejuif.bsky.social @sfbi.fr @helenechiapello.bsky.social @mthomaschollier.bsky.social @nlitb.bsky.social @fred2l.bsky.social @julozi.bsky.social @cnrsbiologie.bsky.social @inserm.fr @inrae-france.bsky.social @jebif.bsky.social @cnrs.fr @pasteur.fr @recherchedatagouv.bsky.social
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 24/07/2026
Retrouvez l’actualité relative au hackathon sur notre site 👉👉https://www.ifb-elixir.fr/generale/hackathon-madbot-x-abromics-developpement-dun-nouveau-plugin/
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 24/07/2026
📢 Hackathon madbot X ABRomics : développement d'un nouveau plugin ! Les 16 et 17 juillet, les équipes de développement #madbotByIFB et #ABRomics se sont réunies à l'Institut Pasteur pour un hackathon dédié à la finalisation du plugin ABRomics pour madbot.
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 23/07/2026
@cnrs-idf-villejuif.bsky.social@sfbi.fr @helenechiapello.bsky.social@mthomaschollier.bsky.social @nlitb.bsky.social @fred2l.bsky.social @julozi.bsky.social @cnrsbiologie.bsky.social @ibisa.net @inserm.fr @inrae-france.bsky.social @jebif.bsky.social @cnrs.fr @pasteur.fr @recherchedatagouv.bsky.social
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 23/07/2026
Vous souhaitez vous abonner ? C’est possible depuis le site internet de l’IFB 👉https://www.ifb-elixir.fr/newsletter/
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 23/07/2026
🔎 Cristal collectif du @CNRS décerné à l'équipe IFB du Core-Cluster ; Retour sur @JOBIM Strasbourg; actualités des plateformes IFB, ELIXIR France ; formations à venir ; dernières publications IFB/ELIXIR-FR ; …
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 23/07/2026
📢 📰 Le dernier numéro des News de l’IFB/ELIXIR-FR est paru !
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 21/07/2026
📣 Vous êtes interessé.e par notre formation "Alphafold et au-delà" qui se déroulera en janvier 2027 à Orsay ? N'attendez plus et pré-inscrivez-vous avant de voguer vers l'horizon des vacances ! 🙂 👇
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 17/07/2026
@cnrs-idf-villejuif.bsky.social @sfbi.fr @helenechiapello.bsky.social @mthomaschollier.bsky.social @nlitb.bsky.social @fred2l.bsky.social @julozi.bsky.social @cnrsbiologie.bsky.social @ibisa.net @inserm.fr @inrae-france.bsky.social @jebif.bsky.social @pasteur.fr @recherchedatagouv.bsky.social
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 17/07/2026
👉 Des questions sur ces nouveautés ? Discutons-en sur Tchap ! www.ifb-elixir.fr/outils-servi... Vous trouverez aussi tous les détails de cette nouvelle version sur gitlab : gitlab.com/ifb-elixirfr... #ProductUpdate #DataManagement #DataBrokering #Research #SoftwareUpdate #Innovation
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 17/07/2026
🎉 Des nouveautés : Export & import d'arborescences complètes ; Page nœud enrichie ; Plugin SSHFS ; etc... ⚡ et bon nombre d'améliorations !
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 17/07/2026
📢 Mise en production de madbot Evenus (1.0.7) Déployée le 9 juillet 2026, nous sommes ravis de partager cette nouvelle version de #madbotByIFB, qui apporte des fonctionnalités majeures, des améliorations de l’expérience utilisateur et des mises à jour importantes côté sécurité.
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 16/07/2026
Encore bravo à notre équipe du core-cluster pour cette belle récompense !! 👏🎉
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Reposted by IFB/ELIXIR-Fr
LABGeM @genolabgem.bsky.social · 02/07/2026
6/ MetaPanG 🧬 a new tool for strain-level profiling of metagenomic samples, powered by pangenome graphs from PanGBank. Going beyond species ID to reveal which strains — and which genes — are really there 🔬 #pangenomics #JOBIM2026 Meet @tlemane.bsky.social at poster 43 👋
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