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IFB/ELIXIR-Fr

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Institut Français de Bioinformatique (IFB) et noeud français d'ELIXIR Europe IFB is the national #bioinformatics infrastructure for #lifesciences communities and the French node of @elixir-europe.org 💻 www.ifb-elixir.fr

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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 02/10/2026
Une nouvelle version de la plateforme #ABRomics est disponible ! Déployée ce 1er octobre, nous sommes heureux d'annoncer la sortie de la version 1.6.0 de la plateforme d'analyse ABRomics. De nombreuses nouvelles fonctionnalités sont à découvrir et explorer, telles que 👇
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 29/09/2026
📢 📰 Le dernier numéro des News de l’IFB/ELIXIR-FR est paru ! 🔎 Au programme : All-hands IFB ; une nouvelle collection HAL pour l’infra (🙏 @cnrs-inist.bsky.social ) ; actualités des plateformes IFB, ELIXIR France ; formations ; dernières publications IFB/ELIXIR-FR ; …
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 28/09/2026
📢 Mise en production de madbot Euriphene Déployée ce 23 septembre 2026, une nouvelle version de #madbotByIFB est disponible ! Nous sommes ravis de partager cette nouvelle version, qui apporte de nouvelles fonctionnalités et des améliorations de l'expérience utilisateur.
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 22/09/2026
Le 17 septembre, Philippe Glaser, Co-Responsable de la Plateforme #ABRomics a participé au webinaire hebdomadaire REMIC’S organisé par la Société Française de Microbiologie.
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 21/09/2026
📢 Le quatrième numéro de la newsletter externe ABRomics est disponible ! 🦠 Au programme de ce nouveau numéro : ABRomics à ECCB 2026, une nouvelle version de la plateforme, un connecteur ABRomics en cours de développement sur madbot…
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 21/09/2026
📢 Du 31 Août au 04 Septembre 2026, Julie Lao (IR sur la PF ABRomics) et Claudine Médigue (co PI ABRomics) étaient à Genève pour participer à la 25e édition de la conférence Européenne annuelle de bioinformatique ECCB (eccb2026.org), organisée par le SIB (Swiss Institute of Bioinformatics).
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 07/09/2026
🚨📢🖥 Maintenance des serveurs IDRIS - Du 14 au 21 septembre 2026, les outils et sites web de l’IFB (site web de l’IFB, site web d'ABRomics, DSW, Fair-checker, OnDemand, etc.) seront indisponibles en raison d’une coupure des serveurs pour maintenance. Merci pour votre compréhension ✨
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 04/08/2026
Une nouvelle version de la plateforme #ABRomics est disponible ! Déployée ce 24 juillet, nous sommes heureux d'annoncer la sortie de la version 1.5.0 de la plateforme d'analyse ABRomics. De nombreuses nouvelles fonctionnalités sont à découvrir et explorer, telles que 👇
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 24/07/2026
📢 Hackathon madbot X ABRomics : développement d'un nouveau plugin ! Les 16 et 17 juillet, les équipes de développement #madbotByIFB et #ABRomics se sont réunies à l'Institut Pasteur pour un hackathon dédié à la finalisation du plugin ABRomics pour madbot.
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 23/07/2026
📢 📰 Le dernier numéro des News de l’IFB/ELIXIR-FR est paru !
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 17/07/2026
📢 Mise en production de madbot Evenus (1.0.7) Déployée le 9 juillet 2026, nous sommes ravis de partager cette nouvelle version de #madbotByIFB, qui apporte des fonctionnalités majeures, des améliorations de l’expérience utilisateur et des mises à jour importantes côté sécurité.
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 10/07/2026
💬 Envie de revivre quelques moments des équipes IFB/ELIXIR-FR à JOBIM Strasbourg ? ✨📹 Pour replonger de nouveau dans les moments forts de cette édition de JOBIM à Strasbourg qui s’est déroulée début juillet, découvrez nos vidéos rétrospective et interviews !
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 09/07/2026
Merci @cnrs.fr ( @cnrsbiologie.bsky.social - @cnrs-idf-villejuif.bsky.social ) pour cette belle distinction qui valorise le travail mené depuis plusieurs années pour développer et maintenir cette infrastructure numérique distribuée 🙏
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 09/07/2026
📢 Le troisième numéro de la newsletter externe ABRomics est disponible ! 🦠 Au programme de ce nouveau numéro : retour sur JOBIM, l’événement annuel de la bioinformatique et de la biostatistique françaises, ABRomics à l’honneur dans le PPR antibiorésistance…
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 03/07/2026
🚀4ème jour et fin de cette édition strasbourgeoise, après une semaine intense et passionnante !! En parallèle de la dernière session posters de ce jobim, 2 demos @ifb-elixir-fr.bsky.social étaient présentées :
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 03/07/2026
🚀 @jobim2026.bsky.social jour 3 ! Une journée placée sous le signe du cycle de vie des données et de la science ouverte ! L'IFB était à l'honneur avec l'organisation et l'animation du mini-symposium « Orchestration des flux de données » ainsi que de nombreuses présentations posters !
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 01/07/2026
🚀 @jobim2026.bsky.social - Retour sur ces deux premiers jours pour les équipes de l'Institut Français de Bioinformatique ! #Bioinformatic #Data
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 30/06/2026
Merci la @sfbi.fr et l'équipe organisatrice de Strasbourg ! 🙏
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 30/06/2026
#JOBIM2026 - Les équipes de l'IFB/ELIXIR-FR sont arrivées à cette nouvelle édition de @jobim2026.bsky.social ! Retrouvez-nous tout au long de la semaine pour des demos et presentations posters, mais aussi sur notre stand à l'entrée, à côté des @jebif.bsky.social 😁🚀
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 29/06/2026
@jobim2026.bsky.social 📣✨ Venez rencontrer les équipes de l’IFB/ELIXIR-FR et découvrir nos présentations tout au long de cette nouvelle édition de JOBIM Strasbourg, l’événement phare de la communauté francophone de bioinformatique : conférences, posters, démos… et bien plus !
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 26/06/2026
📢 🧬🚀 L'Institut Français de Bioinformatique, en partenariat avec l'IDRIS et les plateformes PRABI-AMSB, BIOI2 , CUBIC et Bilille, organise la seconde édition de la formation "AlphaFold et au-delà : Modélisation de la structure 3D des protéines avec des outils d'IA" du 20 au 23 janvier 2027.
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 26/06/2026
@jobim2026.bsky.social - Épisode 10/10 🚀Venez découvrir les 2 posters « Cloud4SAMS: a trusted research environment to handle human gut microbiome data » et « Balancing Open Science and data privacy:the challenge of human microbiome research », qui seront présentés par l'équipe du projet Cloud4SAMS!
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 25/06/2026
📢 Retrouvez l'éditorial réalisé par Claudine Médigue et Philippe Glaser, co-coordinateur du projet ABRomics, diffusé par le Programme prioritaire de recherche antibiorésistance.
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 25/06/2026
@jobim2026.bsky.social - Épisode 9/10 🚀 Rendez-vous cette année pour une démo "Biosphere : Open access to adaptable computing resources within repeatable environments" et un poster "IFB-Biosphère Cloud, Multi-Cloud Infrastructure for Life Sciences" avec une partie de la team du NNCR Cloud de l’IFB!
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 23/06/2026
@jobim2026.bsky.social - Épisode 8/10 🚀 Pour découvrir ViromeChat-AI, rendez-vous cette année pour une démo avec Romuald Marin ! Ce projet est co-porté par Elea Pauliat Paul Tissot Christophe Blanchet.
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 19/06/2026
@jobim2026.bsky.social - Épisode 7/10 🚀 Pour découvrir et adopter madbot, rendez-vous cette année pour une démo et une session poster avec la team #madbotByIFB ! (👋 Imane MESSAK Baptiste Rousseau Elora Vigo Thomas DENECKER Julien Seiler Hélène Chiapello Nadia Goué et le madbot working group)
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 18/06/2026
@jobim2026.bsky.social - Épisode 6/10 🚀 Venez découvrir les 2 posters du PEPR @atlasea.bsky.social « BYTE-Sea:the digital infrastructure of ATLASea, the French marine genome sequencing programme » et « BYTE-Sea:Navigating IT Systems and Web Portals for Sample Tracking and Marine Data Exploitation »
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 17/06/2026
@jobim2026.bsky.social - Épisode 5/10 🚀 Venez découvrir notre poster « RDMkit efficiently manage metabarcoding and metagenomic data », qui sera présenté par Clara EMERY et Erwan Corre !
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 16/06/2026
📣🚀💻 Hackathon de l'équipe de développement d'ABRomics à la Station biologique de Roscoff ! Du 8 au 12 juin, l'équipe de développement d'ABRomics s'est réunie à la Station biologique de Roscoff pour un nouveau hackathon axé sur l'innovation et les développements techniques.
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 15/06/2026
@jobim2026.bsky.social - Épisode 4/10 🚀 L'un des mini-symposiums cette année portera sur « l'orchestration des flux de données tout au long de leur cycle de vie », co-organisé par Thomas Denecker, Jacques van Helden, Fred de Lamotte, Jean-François Dufayard,Alban Gaignard,Nadia Goué,Hamid Ouahioune.
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 12/06/2026
@jobim2026.bsky.social - Épisode 3/10 🚀 Venez découvrir notre poster « Open Science: A Catalogue of European Tools Supporting Research Data Management », qui sera présenté par Saliha Zenboudji-Beddek, Jean-François Dufayard, Sylvain Milanesi, Christophe Bruley et Anne-Françoise Adam-Blondon !
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 12/06/2026
@jobim2026.bsky.social - Épisode 2/10 🚀 Venez découvrir nos 3 posters #ABRomics, qui seront présentés par une délégation de l'équipe projet : Julie Lao Jean Mainguy Raphaël Tackx Amanda Dieuaide Claudine Médigue Philippe Glaser Fabien Mareuil !
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 10/06/2026
@jobim2026.bsky.social - Épisode 1/10 🚀 Venez découvrir notre poster « Structuring and Interoperability of Thematic Data Management Plans for Research Entities », qui sera présenté par Sylvain Milanesi, Saliha Zenboudji-Beddek, Jean-François Dufayard, Christophe Bruley !
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 09/06/2026
📢 Mise en production de madbot 1.6.0 Déployée ce 5 juin 2026, une nouvelle version de #madbotByIFB est disponible ! #ProductUpdate #DataManagement #DataBrokering #Research #SoftwareUpdate #Innovation
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 04/06/2026
Pour le dernier jour,un bilan des développements de la veille et des discussions stratégiques sur la mutualisation des modèles et les perspectives pour une IA académique crédible ont clôturé ces 3 jours. Merci à tous les participants et à très vite pour la suite ! 👏🚀 #Hackathon #IA #Bioinformatique
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 04/06/2026
Après quelques tutoriels autour des outils IA, les participants se sont lancés le 2ème jour dans une session de hacking autour de 8 cas concrets : Amélioration d'EDAM ; Assistant IA pour la sélection d’outils dans Biosphere ; FAIR-Checker MCP ; Spatial RAG pour l’exploration des viromes ; ...
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 04/06/2026
La 1ère matinée était dédiée aux présentations pour poser le cadre, avec notamment un panorama de l’IA en biologie et perspectives pour l’IFB, des interventions sur les RAG, les knowledge graphs, et les initiatives à l’IFB.
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 04/06/2026
👏🚀 Fin de notre #hackathon IA ! Du 1er au 3 juin, la communauté IA de l’IFB s’est réunie pour explorer les applications de l’IA en biologie et faire un état des lieux des travaux en cours.
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 13/05/2026
📢 Mise en production de #madbotByIFB 1.5.0 Déployée ce 12 mai, une nouvelle version de madbot est disponible ! Nous sommes ravis de partager cette nouvelle version, qui apporte des fonctionnalités majeures, des améliorations de l’expérience utilisateur et des mises à jour importantes côté sécurité.
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 12/05/2026
📢 Le deuxième numéro de la newsletter externe ABRomics est disponible !
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 07/05/2026
Aujourd’hui se sont clôturées deux journées de travail lors d’un workshop de formation sur l’utilisation de la plateforme ABRomics à l’institut Pasteur !
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 04/05/2026
🎯 Colloque – Journée IA pour le développement logiciel et l’analyse des données biologiques, organisé par le réseau MERIT, l’ @ifb-elixir-fr.bsky.social et la plateforme iPOP-UP de @upcite.bsky.social 🗓️ Rendez-vous le vendredi 12 juin 2026 à l’Université Paris Cité
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 23/04/2026
📢 Galaxy Advanced Training: Mastering Workflows, Automation, and Scalability: pre-registration open until June 5 2026!
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 21/04/2026
Une nouvelle version de la plateforme #ABRomics est disponible ! Déployée ce 17 avril, nous sommes heureux d'annoncer la sortie de la version 1.4.0 de la plateforme d'analyse ABRomics. De nombreuses nouvelles fonctionnalités sont à découvrir et explorer, telles que 👇
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 14/04/2026
📢🚨Recrutement d’un·e Administrateur·trice système DevOps ! 📍 @bioinfo-genotoul.bsky.social à Castanet-Tolosan (31) 💼 CDD de 16 mois 🔎 www.ifb-elixir.fr/nous-rejoind... #emploi #DevOps #recrutement #INRAE #Data
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 14/04/2026
📢 Mise en production de madbot 1.4.0 Déployée le 09 avril, une nouvelle version de #madbotByIFB est disponible ! #ProductUpdate #DataManagement #DataBrokering #Research #SoftwareUpdate #Innovation
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 13/04/2026
📊 Visualisation des métadonnées ✂️ Support du copier/couper/coller dans l’édition en lot des métadonnées 🗑️ Suppression en lot 🧭 Amélioration de la page de soumission 🔢 Badges de comptage 🛠️ Impersonation administrateur 🔌 Nouvel endpoint API Et bien d'autres améliorations et corrections !
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 03/04/2026
👏 Clôture de la formation ETBI 2026 ! Après 5 jours intensifs à Fréjus, merci et bravo à tous nos participants pour leur engagement et à nos formateurs pour leurs partages enrichissants !
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 30/03/2026
🚀🧬Début de la formation ETBI 2026 à Fréjus ! Au programme de cette semaine, concepts fondamentaux et principales approches en bioinformatique intégrative, ateliers interactifs et sessions de tutorat BYOD (Bring Your Own Data) ! #Bioinformatique #RGCCA #MOFA #Formation
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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 25/03/2026
📢📰 Le dernier numéro des News de l’IFB/ELIXIR-FR est paru ! 🔎 Au programme : Galaxy Community Conference 2026 ; Reportage sur le projet BYTE-Sea ; Workshop Métabarcoding data FAIRification ; actualités des plateformes IFB, ELIXIR France ; formations à venir ; dernières publications IFB/ELIXIR-FR…
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