iiinova — where your digital self keeps evolving

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🍁 Alex Smith 🍁 @alexsmithants.bsky.social · 01/09/2026

🧪 🪲🐜🐛🦟🦗🐞🦋 How many insect species & why it matters. Have a listen to @dirch3.bsky.social speaking with #CBC radio about our recent @pnas.org paper about raising old insect diversity estimates! doi.org/10.1073/pnas... www.cbc.ca/listen/live-...

cbc.ca

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Todd Clardy @realfishdoc.bsky.social · 03/09/2026

A few weeks ago, I ct scanned the rarest fish in the world. This species was described from this single individual, and no other individuals have been collected. Starting Sunday, I'll be segmenting its skeletal system and describing its osteology, and streaming it all live on Twitch! Join me!

youtu.be

Meet the rarest fish in the world!

YouTube video by RealFishDoc

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Natural History Museum of Los Angeles County @nhm.org · 28/06/2026

👀 Our collections keep growing day by day! Dr. Bill Ludt, Assistant Curator of Ichthyology, shares some of the latest additions to the Museum's fish collection.

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ATLASea @atlasea.bsky.social · 10/04/2026

🚀 Exciting Opportunity to come: Launch of the first ATLASea PhD Call, April 16, 2026. More information soon: www.atlasea.fr/en/ #call #applications #marine #genomics #EBP #ERGA #CNRS #CEA #MNHN #ANR #PEPR #France2030

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Eloy Gálvez López @eloygl.bsky.social · 17/11/2025

Very happy that this is finally accessible 😊 Beyond the amazing 3D models that can be downloaded in several formats, @leaveylab.bsky.social added lesson plans for using them in anatomy teaching. We also detail the protocol for AI-based segmentation that I developed during my previous postdoc.

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Florida Museum of Natural History @floridamuseum.bsky.social · 09/12/2025

Tom and John Emmel and Sterling Mattoon officially began their work on “The Butterflies of California” book in 1974. Now, more than 50 years after they began, the book draft has officially been published online and is freely available to the public: www.floridamuseum.ufl.edu/science/the-... 🦋📕

a shallow wooden tray has eight smaller white cardboard boxes in it with rows of carefully preserved and pinned small butterflies, either white with dark freckles or yellow with orange wing tips, seen from directly above

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e-COL+ @e-colplus.bsky.social · 30/11/2025

Louis XV’s rhinoceros enters the digital age 🦏✨ Thanks to the #e-COL+ project, its skeleton and taxidermy have been digitised in #3D, bringing together two historic @mnhn.fr treasures in a unique digital model! Full story here (also in English): ➡️ ecolplus.fr/le-rhinocero...

ecolplus.fr

Le rhinocéros de Louis XV entre dans l’ère numérique - e-COL+

Le rhinocéros de Louis XV entre dans l’ère numérique Offert en 1770 au roi Louis XV par le gouverneur de Chandernagor, ce rhinocéros indien mâle est l’un des spécimens les plus emblématiques du Muséum...

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e-COL+ @e-colplus.bsky.social · 30/11/2025

Le rhinocéros de Louis XV entre dans l’ère numérique 🦏✨ Grâce au projet #e-COL+, son squelette et sa naturalisation ont été numérisés en #3D, réunissant deux trésors historiques du @mnhn.fr dans un modèle numérique unique #PatrimoineNumérique Version détaillée ici : ➡️ ecolplus.fr/le-rhinocero...

ecolplus.fr

Le rhinocéros de Louis XV entre dans l’ère numérique - e-COL+

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e-COL+ @e-colplus.bsky.social · 28/11/2025

Launch of the interdisciplinary hub “Heritage, Collections, Patrimony” at UBE on 24 November 2025 🎓 A day of discussions on physical and digital collections. J. Thomas and E. Fara presented #Récolnat and #e-COL+, highlighting the importance of standardising #FAIR #data.

Kick-off meeting for the interdisciplinary cluster ‘Heritage, Collections, Patrimony’

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e-COL+ @e-colplus.bsky.social · 28/11/2025

Lancement du pôle interdisciplinaire « Héritages, Collections, Patrimoines » de l’UBE le 24 novembre 2025 🎓 Une journée d’échanges sur les collections physiques et numériques. J. Thomas et E. Fara ont présenté #Récolnat et #e-COL+, soulignant l’importance de normaliser les données #FAIR #data

Réunion de lancement du Pôle « Héritages, Collections, Patrimoines » (HCP)

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e-COL+ @e-colplus.bsky.social · 26/11/2025

The palaeonto & geological collections of LGL-TPE (lgltpe.fr/tous-platefo...) are being modernised to make their treasures more accessible thanks to @e-colplus.bsky.social V. Genillon (M1 TPE, UCBL/ENS Lyon) is contributing to the digitisation of #Afrotheria, including sirenians and proboscideans.

3D scanning session of Afrotheria at UCBL

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e-COL+ @e-colplus.bsky.social · 26/11/2025

Les collections paléonto & géologiques du LGL-TPE (lgltpe.fr/tous-platefo...) se modernisent pour rendre leurs trésors plus accessibles grace à @e-colplus.bsky.social Valentin Genillon (M1 TPE, UCBL/ENS Lyon) contribue à la numérisation des #Afrotheria : siréniens et proboscidiens

session de numérisation en 3D des Afrotheria à UCBL

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Ben Miller @extinctmonsters.bsky.social · 18/11/2025

10 years ago, the London NHM cleverly manufactured a controversy when they announced they'd be replacing Dippy the Diplodocus in their main hall with a blue whale skeleton. Long story short, the whale rules, in spite of its notable handicap of not being a dinosaur. 🧵

Enormous whale skeleton suspended in a diving pose in a vast gothic space full of people

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e-COL+ @e-colplus.bsky.social · 06/11/2025

Aide à la #numérisation3D pour #e-COL+ L’équipe Consult.O. (T. Oudoire, H. Bordet) a numérisé plus de 100 types d’ammonites des #collections de l’UCBL (tinyurl.com/ystcv6s2), avec le soutien du labo Biogéosciences (UBE CNRS EPHE), merci Emmanuel Fara ! 🙏 Merci Nicolas Rinder pour la formation !

L'équipe de Consult.O., Thierry Oudoire et Hugo Bordet, a numérisé et reconstruit plus d’une centaine de référents (« types porte-noms ») d’ammonites des #collections de paléontologie-géologie de l’Université Claude Bernard Lyon 1. Merci à Nicolas Rinder pour la formation et l’accompagnement !

👏 L’intervention a pu être réalisée grâce au soutien du Laboratoire de Biogéosciences - UBE CNRS EPHE de l’Université Bourgogne Europe. Merci à Emmanuel Fara !

💡 L'intervention s’inscrit dans le cadre du projet e-COL+. Elle illustre la politique de #numérisation3D, de soutien à la #recherche en #paléontologie et de mise en valeur des collections.

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e-COL+ @e-colplus.bsky.social · 26/10/2025

Fiers de voir #eCOL+ cité par @lsu.bsky.social Museum of Natural Science pour son aide sur des poissons du @mnhn.fr 🐟 Dan Sinopoli a analysé 55 spécimens de poisson-castors et orphies. L'un des spécimens scannés par #eCOL+ présentait les restes de son dernier repas! 👉 www.lsu.edu/mns/files/ne...

Modèle 3D du scan, en tomographie à rayons X, d'un spécimen de poisson-castor. L'encadré blanc met en valeur les restes de son dernier repas

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e-COL+ @e-colplus.bsky.social · 26/10/2025

Proud to see #eCOL+ mentioned by the @lsu.bsky.social Museum of Natural Science for its assistance with the @mnhn.fr fish study 🐟 Dan Sinopoli analysed 55 specimens of bowfin and garfish. One of the specimens scanned by #eCOL+ showed the remains of its last meal! 👉 www.lsu.edu/mns/files/ne...

3D scan of a bowfin from the MNHN, skeletons of stomach contentes circled in white

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e-COL+ @e-colplus.bsky.social · 24/10/2025

"#Biodiversité & #IA" de l’INEE @cnrsecologie.bsky.social a réuni +190 personnes pour explorer les apports de l’IA à la recherche sur la biodiversité. Le projet #eCOL+ était bien représenté 🎤 R. Vignes-Lebbe – IA & Texte 🎤 N. Navarro – IA & Image 🧠 C. Guillaumot – Deep Learning et landmarks 3D

Charlène Guillaumot présente ses travaux sur la pose automatique de landmarks 3D grâce au Deep Learning

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Jaap de Roode @jaapderoode.bsky.social · 17/10/2025

Wow, nature is too cool! Structures on stinkbug hind legs that used to be interpreted as ears are actually chambers with fungi. The bugs coat their eggs in those fungi to protect them against parasitoid wasps. 🧪 Defensive fungal symbiosis on insect hindlegs | Science www.science.org/doi/10.1126/...

science.org

Defensive fungal symbiosis on insect hindlegs

Dinidorid stinkbugs were reported to possess a conspicuous tympanal organ on female hindlegs. In this study, we show that this organ is specialized to retain microbial symbionts rather than to perceiv...

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Brandon Claridge @ichsofna.bsky.social · 17/10/2025

Added a few newly collected Ichneumon species to Ichneumonids of North America. Amazingly, I've found 31 different species based on females when records only show 4 for the state! Compare that with 57 species in Main, which is probably a fairly complete inventory. #entomology #newspecies #taxonomy

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Ben Miller @extinctmonsters.bsky.social · 13/09/2025

A few behind-the-scenes photos of Minimalist Coryphodon. After a couple colleagues expressed disappointment that our “giant” of the Paleocene wasn’t all that giant, I pushed for a more agro pose. I wanted visitors to leave understanding that an animal this size could easily crush them!

Small clay model of a four-legged animal standing sedately. There’s a human figure for scale (Coryphodon shoulders are chest high)

Coryphodon now in head down charging pose. Life sized model in milled foam in a warehouse setting

Finished model painted blue with white cut-out skull and femur. Elbow resting on a bucket

Finished model installed in gallery on yellow platform, surrounded by illuminated illustrations of other animals

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🔬Djigr🦖- D. Dabir-Moghaddam @djigr.bsky.social · 26/09/2025

I’m (finally) reading about Dynastinae morphological character and I stumbled upon Guillaume-Antoine Olivier, who described many species such as Megasoma gyas... in 1789 and in the following years. I like to imagine the guy "Yeah France is on fire rn but I’m going to describe my insects tyvm"

Original drawing from Guillaume-Antoine Olivier of a Megasoma gyas, a huge dark beetle with golden hair and huge horns on torso and head.

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e-COL+ @e-colplus.bsky.social · 03/09/2025

Our website www.ecolplus.fr has a brand-new look ✨ Discover: - the #digitization of French natural history #collections - the equipment available - our partner institutions - a dedicated page for the latest news 👉 And it’s now available in English too!

ecolplus.fr

e-COL+ Numérisation 3D des collections naturalistes.

Projet e-COL+ Numérisation 3D des collections naturalistes a bénéficié d'une aide de l’État PIA3-ANR-21-ESRE-0053

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e-COL+ @e-colplus.bsky.social · 03/09/2025

Le site www.ecolplus.fr fait peau neuve ✨ Vous y trouverez : - une présentation du projet de #numérisation des #collections naturalistes françaises - les équipements disponibles - les partenaires impliqués Et nouveauté : une page dédiée à toutes nos actualités !

ecolplus.fr

e-COL+ Numérisation 3D des collections naturalistes.

Projet e-COL+ Numérisation 3D des collections naturalistes a bénéficié d'une aide de l’État PIA3-ANR-21-ESRE-0053

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e-COL+ @e-colplus.bsky.social · 04/08/2025

Le @mnhn.fr a organisé les #Journées3D. 2 jours pour discuter des données issues de la numérisation 3D des spécimens naturalistes : - pour la #recherche - pour les #collections naturalistes - pour la gestion de ces données Retrouver l'intégralité des présentations ici : youtube.com/playlist?lis...

youtube.com

JOURNEE 3D Produire, analyser, gérer et diffuser les données 3D dans les sciences naturelles : de la conservation des collection naturalistes aux beso - YouTube

Auditorium de la Grande Galerie de l'Evolution, Muséum national d'Histoire naturelle – les 29 et 30/01/2025

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Dr. Jaimi Gray @jaimiagray.bsky.social · 26/06/2025

I used my 3D printer to create educational anatomical models of the brains of fish, frog, & lizard 🐟🐸🦎 The (color-blind friendly) colors demonstrate anatomical regions, and the 🧠 are many times larger than their real size. They can be removed from their stands for closer examination/comparison 🧪

Top: black and white 3D rendering of a dusky basslet fish
Bottom left: purple/pink 3D rendering of the brain of the fish, with a scale bar representing 0.5 mm
Bottom right: A photograph of a 3D printed and painted anatomical model of the fish brain on a white stand, with colors demonstrating anatomical regions.

Top: black and white 3D rendering of a midwife toad
Bottom left: purple/pink 3D rendering of the brain of the frog, with a scale bar representing 1 mm
Bottom right: A photograph of a 3D printed and painted anatomical model of the frog brain on a white stand, with colors demonstrating anatomical regions.

Top: black and white 3D rendering of a plated lizard
Bottom left: purple/pink 3D rendering of the brain of the lizard, with a scale bar representing 3 mm
Bottom right: A photograph of a 3D printed and painted anatomical model of the lizard brain on a white stand, with colors demonstrating anatomical regions.

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e-COL+ @e-colplus.bsky.social · 18/05/2025

Congrats to Camille Berruyer and the NOVITOM team, who presented their poster at #Technart: 4000 arthropod specimens from @mnhn.fr are being digitized using synchrotron microCT at @esrf.fr , with a high-throughput pipeline developed for #e-COL+. #OpenScience #3DImaging

Camille presenting the poster entitled:
From Specimens to Digital Twin: High-Throughput Pipeline for Synchrotron Imaging of Museum Collections

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e-COL+ @e-colplus.bsky.social · 18/05/2025

ScanAllTypes: 362 fish types digitized in 3D, thanks to the operators (👋 @m0neverest.bsky.social , @morganproust.bsky.social et K. Leblanc) and to the ichthyology collection team. A unique expertise in X-ray tomography, to preserve and share the @mnhn.fr's heritage. #OpenScience

3 photos of fish scanned in 3D and key figures for the ScanAllTypes project:
- 362 types scanned
- including 130 holotypes
- spread across 11 orders and 86 families of fish

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e-COL+ @e-colplus.bsky.social · 18/05/2025

362 types de poissons numérisés en 3D grâce aux opérateurs (👋 @m0neverest.bsky.social, @morganproust.bsky.social et K. Leblanc) et aux équipes des collections d'ichtyologie. Un savoir-faire unique en tomo à rayons X, développé pour préserver et partager le patrimoine du @mnhn.fr. #ScienceOuverte

3 photos de poissons numérisés en 3D et chiffres clés du projet ScanAllTypes :
- 362 types scannés
- dont 130 holotypes
- répartis sur 11 ordres et 86 familles de poissons

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e-COL+ @e-colplus.bsky.social · 16/04/2025

La deadline approche (30 avril) N'hésitez pas à envoyer votre candidature si vous voulez participer au projet e-COL+ en tant qu'operateur.ice de numérisation

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Pierre-Yves Beaudouin @pyb75.bsky.social · 29/03/2025

L'occasion de découvrir que les numérisations 3D sont diffusées sous licence libre. Déjà 14000 fichiers proposés ! #ScienceOuverte

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e-COL+ @e-colplus.bsky.social · 28/03/2025

#JobAlert! Nous cherchons un opérateur de numérisation pour le projet e-COL+. Si vous avez de l'expérience avec la numérisation 3D (acquisition ou post-traitement) et avec les collections naturalistes, n'hésitez pas à postuler : recrutement.mnhn.fr/front-jobs-d... 🗓️ Deadline : 30 avril 2025

recrutement.mnhn.fr

Technicien de collection spécialisé en numérisation 3D (F/H) @ Muséum national d'Histoire naturelle

Muséum national d'Histoire naturellerecrute !

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Pauline Provini @paulineprovini.bsky.social · 24/03/2025

Heading to the beautiful Villa Vigoni in #Italy for the second workshop on "Digitisation of Natural History Collections in Europe between Humanities and Natural Sciences" to present the @e-colplus.bsky.social project and reflect on numerical collections. www.villavigoni.eu

villavigoni.eu

Villa Vigoni | Centro italo-tedesco per il dialogo europeo

Home - Villa Vigoni | Centro italo-tedesco per il dialogo europeo - Un laboratorio di idee, un punto di riferimento del dialogo e della collaborazione tra Italia e Germania nel contesto europeo. -

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Dr Juliette @ferrydanini.bsky.social · 18/03/2025

You can now browse through Sorbonne Université's scientific collections' catalogues (including medical collections). They started working on this 4 years ago: colluniv.sorbonne-universite.fr

colluniv.sorbonne-universite.fr

SorbonNum+

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e-COL+ @e-colplus.bsky.social · 26/02/2025

The #e-COL+ project is also digitizing @mnhn.fr arthropod collections 🐛🪰🪳using advanced imaging! For specimens <1 cm, Novitom (www.novitom.com/fr/) captures high-res CT-scans at @esrf.fr #Synchrotron, revealing stunning details—like this 3mm 𝘿𝙖𝙘𝙣𝙚 𝙗𝙞𝙥𝙪𝙨𝙩𝙪𝙡𝙖𝙩𝙖 🪲! www.youtube.com/watch?v=ju_f...

youtube.com

3D non destructive imaging of an insect

YouTube video by Novitom

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Morgan PROUST @morganproust.bsky.social · 14/02/2025

After ct-scanning a school of fish with @killianleblanc and @m0neverest.bsky.social (more than 500 scans), the first amphibian I was lucky enough to scan for the @e-colplus.bsky.social ! Welcome to Quasipaa exilispinosa (MNHN_RA_1988.7891)! @chrisdufresnes.bsky.social @paulineprovini.bsky.social

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Vincent Debat @vincentdebat.bsky.social · 27/01/2025

Bugs of the day: the amazing preponini!

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e-COL+ @e-colplus.bsky.social · 20/01/2025

CT scanning is like a box of chocolates! For this Salamandra terrestris (MNHN-RA-1978-0538) from the @mnhn.fr collections, scanned as part of the #e-COL+ project, we got : - the specimen - Its last meal (an insect) - Eggs, - Tiny fetuses as a bonus!

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Vincent Debat @vincentdebat.bsky.social · 17/01/2025

Each time I work in the collections I am amazed. These specimens were collected 115 y ago

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e-COL+ @e-colplus.bsky.social · 15/01/2025

Après la préparation ostéologique de l'orque de la Seine, chaque os a été numérisé par l'équipe #e-COL+. Cela a permis à l'équipe du @cr2p.bsky.social de remonter le squelette virtuellement. Une façon de mettre en valeur ce 1er squelette complet d'orque au @mnhn.fr !

Os digitialisés en 3D (crane, phalanges et mandibule)

Delphine Brabant numérise un os de l'orque sur la Plateforme Surfaçus avec un laser à bras (Faro)
@MNHN - Julie Dalgaard

Squelette virtuel de l'orque de la Seine, reconstruit à partir de chaque os numérisé

Nathalie Poulet repositionne chaque os individuellement pour reconstruire le squelette virtuel
@MNHN - Julie Dalgaard

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e-COL+ @e-colplus.bsky.social · 10/01/2025

Meilleurs voeux pour la nouvelle année! Une année s'achève et avec elle son lot de numérisations des collections naturalistes du Muséum réalisées dans le cadre du projet #e-COL+. Redécouvrez une partie des collections de la Galerie d'Anatomie Comparée grâce à notre carte de voeux! @mnhn.fr

carte de voeux créée par Andréa Filippo représentant des squelettes montés de la Galerie d'Anatomie Comparée, numérisés pour le projet e-COL+

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Morgan PROUST @morganproust.bsky.social · 06/01/2025

The first two ct-scanned fish of the year for the #e-COL+project! Say hello to Leporinus reinhardti (paratype) and Centropomus mexicanus (holotype)! @e-colplus.bsky.social

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e-COL+ @e-colplus.bsky.social · 31/12/2024

14 102 numérisations 3D ont été réalisées depuis juin 2021 grâce à l'acquisition de nombreux équipements par l'Université de Lyon (UCBL), l'Université de Bourgogne (UB) et le Muséum national d'Histoire naturelle (@mnhn.fr)

Scène montrant une saisie 3D en lumière structurée, © CNRS - Simon Bianchetti

Image montrant un spécimen en cours de numérisation par l'Artec Micro, à l'Université de Bourgogne

Numérisation d'un gorille par le GoScan Park dans les collections du MNHN

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