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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 30/09/2026

📜 Project Showcase 🛠️ PUMA: 3D Printed Open Source Microscope 👩‍💻 🧑‍💻 Developed by Paul J. Tadrous 👀 To learn more about it: open-neuroscience.com/en/post/puma... 👉 Read their manuscript: onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/... #OpenHardware #OpenScience #OpenSource #OpenNeuroscience

PUMA is backed up by a peer-reviewed paper in the
Journal of Microscopy and designed for direct eye
observations and ultra-portability with advanced
options for digital imaging, measurements and
computer control.
PUMA is an acronym for:
[P]ortable, [U]pgradeable, [M]odular, [A]ffordable.

• Portable: PUMA is totally portable. Not only is it
small and lightweight but it does not require
a computer, smart phone, camera or PC monitor
to operate.
• Upgradeable and Modular: PUMA can used as
a simple but high quality monocular microscope
with an adjustable mirror for illumination,
all the way through a trinocular scope with full
Kohler illumination and an augmented reality unit
for a HUD of its integrated computer.
• Affordable and Open Source: All aspects of the
PUMA are open source and not monopolised
behind paywalls and patents. It is designed to be
built by anyone with access to 3D printing and uses
fixtures and fittings available from retail outlets.

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 09/09/2026

📜 Apresentação de um projeto de #CienciaAberta 🛠️HistoEnder: Sistema automatizado para coloração de lâminas histológicas 👩‍💻 🧑‍💻 Desenvolvido por: Marco Ponzetti 👀 Para saber mais sobre o projeto: open-neuroscience.com/en/post/hist... 👉 Leia o artigo sobre o HistoEnder: engrxiv.org/preprint/vie...

Apresentação do Projeto
HistoEnder
Sistema automatizado para coloração
de lâminas histológicas

O HistoEnder é baseado em uma impressora 3D que
utiliza um sistema de movimentação cartesiano clássico.
O equipamento consegue movimentar o suporte com
lâminas pelos diferentes recipientes contendo solventes
e soluções de coloração, de forma totalmente programável,
se adaptando a qualquer protocolo. Por ser extremamente
versátil, pode ser empregado para diversos procedimentos
de coloração citológica e histológica.

Principais vantagens do HistoEnder:
• Economiza horas de trabalho manual, uma vez
que automatiza protocolos manuais de
longa duração;
• Aumenta a consistência das colorações entre
diferentes seções, melhorando a reprodutibilidade
experimental;
• Amplamente adaptável: desde esfregaços e cortes
de tecidos incluídos em parafina até cortes
congelados incluídos em OCT e amostras de tecidos
rígidos incluídos em PMMA;
• Para além da histologia: pode realizar
revestimentos por imersão (dip coating) para
laboratórios de ciência dos materiais e química.

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 04/08/2026

📜 Project Showcase 🛠️ HistoEnder: 3D printer-based histological slide autostainer 👩‍💻 🧑‍💻 Developed by Marco Ponzetti 👀 To learn more about it: open-neuroscience.com/en/post/hist... 👉 Read their manuscript: engrxiv.org/preprint/vie... #OpenSoftware #OpenScience #OpenSource

The HistoEnder is based on a Cartesian FDM
3D printer, and works by moving a slide rack
loaded with microscope slides through different
solvent/staining jars, in a fully programmable
fashion. This makes the machine incredibly
versatile and able to perform several cytological/
histological staining jobs automatically.

The HistoEnder:
• Saves hours of manual staining to researchers
who currently do such procedures by hand;
• Increases staining consistency between runs
thus increasing experimental reproducibility;
• Can be adapted to a variety of procedures
starting from smears, paraffin-embedded sections,
OCT-embedded cryosections and even
PMMA-embedded hard tissue samples;
• Can perform dip coatings for material science
and chemistry laboratories;

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 30/07/2026

📜 Apresentação de um projeto de #CienciaAberta 🛠️pyControl: Um hardware aberto para registrar experimentos comportamentais 🧑‍💻 Desenvolvido por: Thomas Akam 👀 Para saber mais: open-neuroscience.com/en/post/pyco... 👉 Leia o artigo sobre o pyControl: elifesciences.org/articles/67846

Project Showcase
pyControl
Um hardware aberto, desenvolvido em Python,
para registrar experimentos comportamentais

O pyControl é um sistema de hardware e software
abertos para auxiliar na aquisição de experimentos
comportamentais em neurociência e psicologia.
Trata-se de uma plataforma baseada em
microcontroladores programados com MicroPython.

O pyControl é uma ferramenta intuitiva e adaptável
que foi projetada para atender necessidades comuns
em testes de neurociência comportamental, como:
(1) Definir tarefas comportamentais utilizando máquinas de
estados finitos (modelos que descrevem as diferentes etapas
de um experimento e as transições entre elas).
(2) Executar experimentos de forma eficiente, permitindo
estudos comportamentais de alto rendimento.
(3) Facilitar o compartilhamento e a reprodução dos métodos
experimentais entre pesquisadores da área.

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 07/07/2026

📜 Project Showcase 🛠️ pyControl: Open source, Python-based, behavioural experiment control. 👩‍💻 🧑‍💻 Developed by Thomas Akam 👀 To learn more about it: open-neuroscience.com/en/post/pyco... #OpenSoftware #OpenScience #OpenSource

pyControl is a system of open source hardware
and software for controlling behavioural
experiments in neuroscience and psychology,
built around the MicroPython microcontroller.

pyControl is a user-friendly and flexible tool
addressing a commonly encountered use case
in behavioural neuroscience:
(1) Defining behavioural tasks as extended state machines.
(2) Running them efficiently as high-throughput experiments.
(3) Communicating task logic to other researchers

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 30/06/2026

📜 Apresentação de um projeto de #CienciaAberta 🛠️suite2p: Pipeline para dados de imagem de cálcio por microscopia de dois fótons 👩‍💻 🧑‍💻 Equipe: Carsen Stringer e Marius Pachitariu 👀 Para saber mais: open-neuroscience.com/en/post/suit... 🎥 Entrevista com Carsen Stringer: www.youtube.com/live/Zxbz2OU...

Apresentação do Projeto
suite2p
Fluxo de processamento
(Pipeline) para dados
de imagem de cálcio
por microscopia de
dois fótons

O Suite2P é um fluxo de processamento
modular desenvolvido em Python que permite
realizar o registro de imagens, a detecção
automática de células, a extração de sinais
de cálcio e a inferência da atividade neuronal

Trata-se de uma ferramenta rápida e precisa que
pode ser executada em computadores de uso
comum. Também conta com uma interface gráfica
de usuário (GUI), que facilita a visualização e a
análise dos dados, além de permitir a revisão e o
refinamento manual dos resultados gerados pelo
algoritmo de detecção celular.

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 16/06/2026

📜 Apresentação de um projeto de #CienciaAberta 🛠️BioAmp exg pill: Hardware de código aberto para amplificação de biosinais. 👩‍💻 🧑‍💻 Desenvolvido por: Deepak Khatri 👀 Para saber mais sobre o projeto: open-neuroscience.com/en/post/bioa...

Apresentação do Projeto
BioAmp
exg pill
Uma placa compacta e elegante
de front-end analógico (placa de
circuito frontal) para aquisição
de biosinais

O BioAmp EXG Pill é capaz de registrar sinais
biológicos com qualidade compatível com
publicações científicas, incluindo eletrocardiograma
(ECG), eletromiografia (EMG), eletrooculografia (EOG)
e eletroencefalografia (EEG), sem a necessidade de
filtros específicos de hardware ou software.

O BioAmp EXG Pill é compatível com qualquer
microcontrolador de 5V que esteja equipado com
conversor analógico digital (ADC), como o Arduino
Uno ou Nano, bem como com outros ADCs
compatíveis com 5V, como o ADS1115.
Este projeto foi desenvolvido utilizando o software
KiCad, e todos os arquivos de design estão disponíveis
publicamente na página oficial do projeto no GitHub!

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 09/06/2026

📜 Project Showcase 🛠️ UBioAmp exg pill: Open-source hardware for biopotential amplification. 👩‍💻 🧑‍💻 Developed by: Deepak Khatri 👀 To learn more about it: open-neuroscience.com/en/post/bioa... #OpenScience #OpenSource #OpenHardware #Neuroscience

BioAmp
exg pill
A small and elegant
Analog Front End board for
BioPotential signal acquisition

BioAmp EXG Pill is capable of recording
publication-quality biopotential signals like
ECG, EMG, EOG, and EEG, without the inclusion
of any dedicated hardware or software filters.

BioAmp EXG Pill works with any 5V microcontroller
with an ADC like Arduino UNO/Nano, or dedicated
5v compatible ADC like ADS1115.
BioAmp EXG Pill has been created using KiCad
and all design files are available in the
project’s github page.

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 03/06/2026

📜 Apresentação de um projeto de #CienciaAberta 🛠️ Mini microscópios da UCLA: Microscópios de fluorescência com hardware aberto para o registro da atividade neural in vivo 👩‍💻 🧑‍💻 Daniel Aharoni; Peyman Golshani; Alcino Silva; Baljit Khakh; Denise Cai; Tristan Shuman 🔗https://tinyurl.com/3d9w7k7x

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 26/05/2026

📜 Project Showcase 🛠️ UCLA Miniscope Project: #OpenSource miniaturized fluorescence microscopes for in vivo neural recording in freely behaving animals. 👨‍🔬👩‍🔬 Team: Daniel Aharoni; Peyman Golshani; Alcino Silva; Baljit Khakh; Denise Cai; Tristan Shuman 👀 To learn more: tinyurl.com/3d9w7k7x #OpenScience

The goal of the project is to lower the barrier to
high-quality in vivo calcium imaging in freely
behaving animals by making the underlying tools,
training, and know-how openly available, regardless
of budget or in-house engineering capacity.

Each Miniscope pairs custom optics, electronics,
and firmware with open hardware designs,
data-acquisition software, and analysis pipelines.
The platform spans the full stack of needs to go
from surgery to publishable findings, with a
global community of researchers using and
contributing hardware, software, and methods.

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 21/05/2026

📜 Apresentação de um projeto de #CienciaAberta 🛠️ Projeto Humano Visível: um banco de dados de imagens anatômicas de corpos masculinos e femininos.. 👩‍💻 🧑‍💻 Desenvolvido pela: U.S. National Library of Medicine 👀 Para saber mais sobre o projeto: open-neuroscience.com/en/post/the-...

Apresentação do Projeto
Projeto Humano Visível
Base de dados aberta ao público contendo imagens
anatômicas em cortes transversais obtidas por
criosseccionamento (corte de tecidos biológicos congelados),
tomografia computadorizada (TC) e ressonância magnética
(RM) de um corpo masculino e um feminino.

A longo prazo, o Projeto Humano Visível tem
como objetivo desenvolver um sistema de modelos
estruturados de informação sobre anatomia,
integrando, de forma transparente, informações
visuais com formatos simbólicos de conhecimento,
como a nomenclatura das estruturas anatômicas
do corpo humano.

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 12/05/2026

📜 Project Showcase 🛠️ The Visible Human Project: a database of anatomical images from male and female bodies. 👩‍💻 🧑‍💻 Developed by: U.S. National Library of Medicine 👀 To learn more about it: open-neuroscience.com/en/post/the-... #OpenScience

Visible Human Project
Public-domain library of cross-sectional cryosection,
CT, and MRI images of one male and one female body

The long-term goal of the Visible Human Project
is to produce a system of knowledge structures
that will transparently link visual knowledge forms
to symbolic knowledge formats such as the
names of body parts.

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 05/05/2026

📜 Apresentação de um projeto de hashtag#CienciaAberta 🛠️ Projeto Yale “Mão Aberta”: uma iniciativa para promover o design e o uso de mãos robóticas. 👩‍💻 🧑‍💻 Equipe: Prof. Aaron M. Dollar and Vatsal V. Patel 👀 Para saber mais sobre o projeto: open-neuroscience.com/en/post/the_...

As mãos robóticas disponíveis comercialmente
costumam ser caras e difíceis de modificar ou adaptar.
Este projeto visa desenvolver diversos modelos
de mãos robóticas com código aberto, e com
a contribuição da comunidade, atualizar e
ampliar continuamente o design desses
modelos, gerando diferentes variações e
melhorias úteis para os pesquisadores.

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 23/04/2026

📜 Apresentação de um projeto de #CienciaAberta 🛠️ SpikeInterface: Um sistema integrado para identificar e classificar os sinais elétricos dos neurônios 🧑‍💻 Alessio Buccino; Cole Hurwitz; Samuel Garcia; Jeremy Magland; Josh Siegle; Matthias Hennig 👀 Para saber mais: open-neuroscience.com/en/post/spik...

SpikeInterface:
Um sistema integrado para
identificar e classificar os sinais
elétricos dos neurônios

O SpikeInterface é um pacote unificado,
em Python, para classificar os impulsos
elétricos dos neurônios.
• Possui uma interface de programação feita para ser
simples e fácil de usar, ja que oferece comandos
prontos e intuitivos.
• Na prática, permite que os usuários construam
esquemas complexos para analisar e classificar
os sinais dos neurônios com poucas linhas de código.

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 21/04/2026

📜 Project Showcase 🛠️ SpikeInterface: a unified framework for spike sorting 👩‍💻 🧑‍💻 Developed by Alessio Buccino; Cole Hurwitz; Samuel Garcia; Jeremy Magland; Josh Siegle; Matthias Hennig 👀 To learn more about it: open-neuroscience.com/en/post/spik... #OpenScience #OpenNeuroscience #Neuroscience

SpikeInterface is a unified Python
framework for spike sorting.
• With its high-level API, it is designed
to be accessible and easy to use.
• Allows users to build full analysis
pipelines for spike sorting with a few
lines of code.

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 09/04/2026

📜 Apresentação de um projeto de #CienciaAberta 🛠️ NeuroFedora: Sofware aberto para neurociência aberta 💡 NeuroFedora é um sistema operacional Linux para a comunidade de #neurociência 👩‍💻 🧑‍💻 Criado pelo.a.s voluntário.a.s do The Fedora Project 👀 Para saber mais: open-neuroscience.com/en/post/neur...

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 07/04/2026

📜Project Showcase 🛠️ NeuroFedora: Free software for Free neuroscience 💡 It is a Linux operating system developed specially for the hashtag#neuroscience community 👩‍💻 🧑‍💻 Developed by NeuroFedora volunteers at The Fedora Project 👀 To learn more about NeuroFedora: open-neuroscience.com/en/post/neur...

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 26/03/2026

📜 Apresentação de um projeto de #CienciaAberta 🛠️ Microscópios OpenFlexure: uma plataforma / suporte de posicionamento flexível, impressa em 3D. 👨‍🔬 Desenvolvido por Joe Knapper 👀 Para saber mais sobre o OpenFlexure: open-neuroscience.com/en/post/open...

Apresentação do projeto: Microscópios OpenFlexure

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 24/03/2026

📜 Project Showcase 🛠️ OpenFlexure microscopes: a 3D printed flexure translation stage. 👨‍🔬Joe Knapper 👀 To learn more about OpenFlexure: open-neuroscience.com/en/post/open... #OpenScience #OpenNeuroscience #OpenHardware #OpenSource

OpenFlexure is a 3D printed flexure translation stage

OpenFlexure is a 3D printed flexure translation stage, developed by a group at the Bath University. The stage is capable of sub-micron-scale motion, with very small drift over time. Which makes it quite good, among other things, for time-lapse protocols that need to be done over days/weeks time, and under space restricted areas, such as fume hoods.

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 10/03/2026

👋 Olá, comunidade de ciência aberta :) 👉 Esse é o nosso último post nessa série de publicações dedicada a apresentar nossa equipe. 🤩 Nosso time não seria completo sem o Stephen Keller #cienciaaberta #neurociencia

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 03/03/2026

👉 This is our final post—but certainly not the least—in our series dedicated to presenting our team members. 🤩 Our team wouldn't be complete without Stephen Keller

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 24/02/2026

👋 Olá, querida rede de seguidore.a.s :) 🤩 Temos o prazer de apresentar o Gabriel Costa, PhD, que faz parte da nossa equipe! 👀 Acompanhe nossas próximas publicações para saber tudo sobre a nossa equipe!

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 17/02/2026

🎉 Happy Tuesday, everyone :) 🤩 It is with great pleasure that we introduce our team member, Gabriel Costa. 🖇️ Stay tuned to meet our other team members and don't hesitate to connect with us!

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 05/02/2026

👋 Olá, entusiastas da neurociência aberta :) 😍 Temos o prazer de apresentar mais uma pessoa da nossa equipe! 🤝 Apresentando... Luisa Pimentel :) 🎉 Nos próximos posts você vai descobrir os outros membros da nossa equipe 📨 Não hesitem em entrar em contato.

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 04/02/2026

🙌 Hello, Open Neuroscience friends! 😍 We are pleased to introduce another member of our team. 🖇️ Stay tuned to meet our other team members and don't hesitate to connect with us!

Presenting our team member: Luisa Pimentel

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 30/01/2026

🙌 Olá, comunidade querida! 😍 Temos o prazer de apresentar a nossa equipe nessa nova série de posts. 👀 Fiquem de olho nas nossas próximas publicações e não hesitem em nos contatar! #CienciaAberta

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 29/01/2026

🙌 Hello, beautiful community! 😍 It is our pleasure to present our team members in this new series of posts. 🖇️ Stay tuned and don't hesitate to connect with us! #OpenCode #OpenNeuroscience #Neuroscience #OpenScience #OpenSource #OpenSoftware #OpenHardware

Andre Maia Chagas - Lecturer in Open Science

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 22/01/2026

(1/2) Olá, comunidade! Feliz ano novo! 🎉 💡 Faz tempo que não postamos por aqui, mas é por um bom motivo! 💪 O nosso time estava preparando posts mais interessantes e dinâmicos. 😍 Esperamos que vocês gostem! 🖼️ Arte gráfica: Stephen Keller 🔤 Texto: Gabriel Costa, Luisa Pimentel, e André Maia Chagas

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 22/01/2026

(2/2) 👀 Para saber mais, accesse nosso website (em breve também em Português): open-neuroscience.com/en/ 🖇️ Conecte-se conosco via LinkedIn: www.linkedin.com/company/open... ✍ Escreva para a gente no e-mail: info@open-neuroscience.com #CienciaAberta #Neurociencia

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 21/01/2026

(1/2) Hello, fellow Open Neuroscience enthusiasts! Happy New Year! 🎉 💡 It's been a while, but for a good reason! 💪 Our team has been working hard to bring you even more engaging and interesting content on social media! :) 😍 We hope you enjoy our new posts. Let us know what you think! #OpenScience

What is the Open Neuroscience Initiative?

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 21/01/2026

(2/2) 🖼️ Graphic art by Stephen Keller 🔤 Content by Gabriel Costa, Luisa Pimentel, and André Maia Chagas! 👀 For more, access our website: open-neuroscience.com/en/ 🖇️ Connect with us on LinkedIn: www.linkedin.com/company/open... ✍ Contact us at: info@open-neuroscience.com #OpenSource #Neuroscience

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 13/10/2025

🥳Join us in celebrating our new team member! 🧑‍💻Stephen Keller 🧠He is a designer and researcher who holds an MA from McGill University, where he explored #OpenScience in the context of digital humanities. 💡He is co-creating the Portuguese version of our website! Learn more & contact Stephen👇

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 29/09/2025

🥳Join us in celebrating our new team member! 👨‍🔬Gabriel Araujo Costa, PhD 🧠He has expertise in toxicology, pharmacology, neurobiology, and behavior, with a particular focus on drug addiction and rare diseases. 💡He is co-creating the Portuguese version of our website! Learn more & contact Gabriel👇

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 17/09/2025

📹Webinar recording on NeuroFedora 💡An initiative to provide a ready-to-use Fedora Linux-based Free #OpenSource software platform for #neuroscience. 🧑‍💻Ankur Sinha 🔗https://www.youtube.com/live/2xAK1tY0qro?si=EuQurVxlXwm8qexS #OpenScience #OpenNeuroscience

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 07/09/2025

📹Webinar recording on PiVR 💡The Raspberry Pi-based Virtual Reality system (PiVR)is a system that allows experimenters to immerse small animals in virtual realities. 👨‍🔬With David Tadres & Matthieu Louis 🔗https://www.youtube.com/watch?v=uG898FL421U&t=183s #OpenScience #Neuroscience #OpenNeuroscience

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 15/07/2025

📹OpenFlexure: a 3D printed flexure translation stage. 💡The stage is capable of sub-micron-scale motion, with very small drift over time. It is ideal for time-lapse protocols that need to be done in space-restricted areas, such as fume hoods. 👨‍🔬Joe Knapper 🔗https://www.youtube.com/watch?v=__mND9BFOts

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 20/05/2025

🔊New resource: The Behaviour Forum, a place to discuss experimental methods in animal behaviour 💡This is a global platform bringing together scientists, technicians, and animal welfare experts to advance the study of animal behaviour. 👩‍🔬By COST-TEATIME 🔗Link: open-neuroscience.com/en/post/a_pl...

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 09/05/2025

🔊New resource: Bombcell, automated quality control for extracellular electrophysiology 💡This is an #opensource, user-friendly toolbox that streamlines quality control for spike sorting outputs. 👩‍🔬Develop by Julie M. J. Fabre 🔗Link: open-neuroscience.com/en/post/bomb... #OpenScience #Neuroscience

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 02/05/2025

💡Democratizing Smart Microscopy with navigate: #opensource Python software to harness the full potential of light-sheet microscopy, empowering researchers with a flexible and innovative platform for smart microscopy. 👨‍🔬Zach Marin, Xiaoding Wang, Dax Collison, Conor McFadden, Kevin Dean More details👇

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 22/04/2025

💡NC4Gate: A modular gate system for autonomous control of rodent behavior. 🐭 This is a robust mechanical design that can be built using low-cost #openhardware and execute thousands of cycles before maintenance. 👨‍🔬Adam W. Lester, Gurnoor Kaur, Nadira Djafri, Manu S. Madhav More details and link 👇

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 02/04/2025

💡Towards open meta-research in neuroimaging 👀Find out about living meta-research, the prequels to this idea, and discover the standards and technologies that could assist researchers in doing living meta-research! 👩‍💻Kendra Oudyk @kendra-oudyk.bsky.social et al. Full list of collaborators and link👇

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 21/03/2025

🖇️Neurobagel aims to connect decentralized neuroimaging datasets using linked data principles while allowing data files and access control to remain with research institutes. 🧑‍💻Sebastian Urchs; Alyssa Dai; Arman Jahanpour; Neurobagel contributors; Jean-Baptiste Poline 🔗Link and more in the comments

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Open Neuroscience @open-neuroscience.com · 04/03/2025

💡NeuroML is an international, collaborative initiative to develop a language and associated software ecosystem for working with data-driven biophysically detailed models of neural systems. 👨‍🔬Padraig Gleeson; Ankur Sinha; Boris Marin; Robert Cannon 🔗Link and more in the comments 👇

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