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Markus Sitzmann

@markussitzmann.bsky.social
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#scientist #cheminformatics #datascience #patents #FIZKarlsruhe

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Reposted by Markus Sitzmann
Greg Landrum @greglandrum.bsky.social · 28/03/2026
We did a new major #RDKit release yesterday. v2026.03.1 is out and the conda-forge builds are available. As always, especially with major releases, be sure to read the "Backwards incompatible changes" section of the release notes! github.com/rdkit/rdkit/...
github.com
Release 2026_03_1 (Q1 2026) Release · rdkit/rdkit
Release_2026.03.1 (Changes relative to Release_2025.09.1) Acknowledgements (Note: I'm no longer attempting to manually curate names. If you would like to see your contribution acknowledged with you...
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Markus Sitzmann @markussitzmann.bsky.social · 27/05/2026
After a (family-caused) hiatus, I decided to refresh my already 10 year old Chembience project. Well, by the means of KI, it ended up as a much improved full re-implementation - maybe it is helpful to some: #cheminformatics #chemistry #rdkit github.com/chembience/c...
github.com
Release Chembience re-implementation · chembience/core
This release superceeds the chembience releases at https://github.com/chembience/chembience (v<=0.4.0) and starts at version 0.5.0. The repository provides a full KI-based re-implementation of the ...
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Markus Sitzmann @markussitzmann.bsky.social · 26/04/2026
Und schon wieder hat mich @deutschebahn.com erwischt - heute, Sonntag morgens mit Totalausfall. Und der Hinweis auf Ersatzverbindungen auszuweichen, ist genau mein Sonntagmorgen-Humor …
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Markus Sitzmann @markussitzmann.bsky.social · 03/04/2026
Zug fahren mit @deutschebahn.com geht offensichtlich grundsätzlich nicht mehr ohne Kasperletheater by @deutschebahn.com mehr …
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Markus Sitzmann @markussitzmann.bsky.social · 12/03/2026
www.linkedin.com/feed/update/...
linkedin.com
Applications Invited for CSA Trust Grants for 2026. | Markus Sitzmann
Applications Invited for CSA Trust Grants for 2026.
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Dr. Fiona @fionachembot.bsky.social · 26/09/2025
An incredible description of a retroactively applied alternate history analysis demonstrating the impact of what medical advancements we would be without with a 40% reduction to the NIHs budget.
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Markus Sitzmann @markussitzmann.bsky.social · 26/09/2025
Ich bin nun wahrlich kein Stadtplaner oder Verkehrsplaner, aber ich hätte das durch anschauen der Straßenplans vorhersagen können: www.spiegel.de/auto/a100-in...
spiegel.de
(S+) A100 in Berlin: Wie Deutschlands teuerster Autobahnabschnitt den Verkehr lahmlegt – Datenanalyse
Blockierte Kreuzungen, aggressive Autofahrer, frustrierte Anwohner: Der neu eröffnete Abschnitt der A100 sorgt seit Wochen für Chaos in Berlin. Die Gegenmaßnahmen der Stadt helfen offenbar kaum.
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Markus Sitzmann @markussitzmann.bsky.social · 09/08/2025
Sorry, but ChatGPT-5 really sucks and they don’t allow going back to older models anymore. Really disappointing
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Elisabeth Bik @elisabethbik.bsky.social · 29/07/2025
These phrases are almost funny, because they are over-synonymized. The authors presumably were trying to cover up plagiarism by using a tool that changes words into synonyms, so they would not be detected by a plagiarism detection tool. More info here: arxiv.org/abs/2107.06751
arxiv.org
Tortured phrases: A dubious writing style emerging in science. Evidence of critical issues affecting established journals
Probabilistic text generators have been used to produce fake scientific papers for more than a decade. Such nonsensical papers are easily detected by both human and machine. Now more complex AI-powere...
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Markus Sitzmann @markussitzmann.bsky.social · 02/07/2025
Unsere neuen Reaktoren wären dann in so 30 bis 50 Jahren startklar … www.spiegel.de/wissenschaft...
spiegel.de
Hitze: Auch die Schweiz fährt ein Atomkraftwerk runter
Erst Frankreich, jetzt auch die Schweiz: Weil das Kühlwasser zu warm ist, musste ein Atomkraftwerk zum Teil abgeschaltet werden. Der Betreiber des AKW Beznau gibt als Grund den Schutz des nahe gelegen...
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Figen @thefigen.bsky.social · 15/06/2025
A dazzling ocean of tulips stretching endlessly in Hokkaido, Japan...
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Markus Sitzmann @markussitzmann.bsky.social · 05/06/2025
Manchmal kann man über unsere Politiker einfach nur staunen - wir wollen alle ein »Rundum-sorglos-Paket«, auch die inländischen Forscher www.spiegel.de/politik/deut...
spiegel.de
Ministerin Bär plant »Rundum-sorglos-Paket« für ausländische Forschende
US-Präsident Trump macht ihnen das Forschen schwer, Wissenschaftsministerin Bär will nun Spitzenkräfte von US-Hochschulen nach Deutschland holen. Parteifreund Söder schwärmt bereits von einem »Exilcam...
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Markus Sitzmann @markussitzmann.bsky.social · 23/05/2025
Mike Lynch Award 2025: Professor Val Gillet csa-trust.org/2025/05/23/m...
csa-trust.org
Mike Lynch Award 2025: Professor Val Gillet
In recognition of her pioneering research in chemical structure analysis, visionary educational leadership, and enduring dedication to advancing scientific collaboration, Professor Val Gillet has b…
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Markus Sitzmann @markussitzmann.bsky.social · 11/05/2025
You can regard yourself senior in the field of Cheminformatics if you can spell the word "Noordwijkerhout" without spelling mistake ... #cheminformatics
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Markus Sitzmann @markussitzmann.bsky.social · 29/04/2025
So, bei mir ist jetzt alles veräppelt 🙂
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Markus Sitzmann @markussitzmann.bsky.social · 21/04/2025
Well, ... #science #scientificFraud #predatoryJournals www.nature.com/articles/d41...
nature.com
Invasion of the ‘journal snatchers’: the firms that buy science publications and turn them rogue
Study finds dozens of journals that have hiked their fees and started churning out papers after being acquired by small, recently formed companies.
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Markus Sitzmann @markussitzmann.bsky.social · 07/04/2025
White blossoms before green leaf background
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Markus Sitzmann @markussitzmann.bsky.social · 28/03/2025
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Markus Sitzmann @markussitzmann.bsky.social · 28/03/2025
White blossoms, blue sky
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Our World in Data @ourworldindata.org · 26/03/2025
Rising global temperatures can influence the timing of events, such as when crops are ready to plant and harvest and when flowers and trees bloom. One example is the timing of the peak cherry tree blossom in Kyoto, Japan, where records stretch back to the ninth century — that’s over 1200 years.
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Karlsruhe Institute of Technology (KIT) @kit.edu · 26/03/2025
Aufgrund der geopolitischen Umwälzungen droht der #Klimawandel von der Agenda zu rutschen. Mehr als 13.700 Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler, darunter 379 aus dem KIT, schließen sich daher einem bundesweiten Appell an und fordern ein Umdenken. www.kit.edu/kit/202503-f...
Symbolbild: Schäden nach einem Extremwetterereignis 2024 in und rund um Bruchsal im nördlichen Landkreis Karlsruhe
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Markus Sitzmann @markussitzmann.bsky.social · 25/03/2025
Heidelberg, Mannheim and Ludwigshafen.
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Markus Sitzmann @markussitzmann.bsky.social · 23/03/2025
Na, da schlaf ich jetzt dann wieder ruhiger, oder?
Spiegel-Schlagzeile, dass Putin nicht ganz Europa einnehmen will.
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Markus Sitzmann @markussitzmann.bsky.social · 23/03/2025
I just told the AI to rewrite its just generated Text in a form that the AI detector service doesn't recognized it as AI-generated. It worked 👀
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Markus Sitzmann @markussitzmann.bsky.social · 22/03/2025
Spring blossom photo
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Jacek Debiec, MD, PhD, DPhil 🌎 🧠 @drjacekdebiec.bsky.social · 20/01/2025
There was a lot of #AcademicFreedom, good scholarship, and independent thought in German universities before Hitler. After Hitler had risen to power, many academics fled the country. Some resisted the Nazi regime and were persecuted. Most adapted to a new situation. Here are some examples. 1/n
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Markus Sitzmann @markussitzmann.bsky.social · 08/03/2025
Es wird Frühjahr! Man hört es aus den Nachbargärten.
media.tenor.com
a man with a tattoo on his arm is using a chainsaw
ALT: a man with a tattoo on his arm is using a chainsaw
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Peter Breuer @peterbreuer.bsky.social · 02/03/2025
Natürlich ist es Eskapismus, aber die Nachrichtenlage ist so, dass ich am liebsten nur noch irgendwas hinkritzele und Adobe Firefly sage: „Los, mach mir ein Stofftier mit einer gepunkteten roten Hose daraus!“
Schwarzweiße Zeichnung eines Fantasietiers mit einer BadehoseDasselbe Tier als flauschiges Stofftier mit einer gepunkteten roten Badehose
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Markus Sitzmann @markussitzmann.bsky.social · 28/02/2025
#iBetterStayAway
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Markus Sitzmann @markussitzmann.bsky.social · 25/02/2025
In these times even the smallest pleasures might help
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James Bradley @drbradbrad.bsky.social · 23/02/2025
Pictured here behind Laura - the UK Arctic Research Station located in Ny-Ålesund, Svalbard - the northernmost permanent settlement in the world. The building is being moved off its foundations because it is sinking into the thawing permafrost.
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Markus Sitzmann @markussitzmann.bsky.social · 23/02/2025
Mir ist immer noch schleierhaft, welchen Ausgang sich Herr Lindner für heute Abend vorgestellt hat, als er letzten November den "D-Day" geplant hat?
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Greg Landrum @greglandrum.bsky.social · 21/02/2025
The new #RDKit blog post is a tutorial on highlighting atoms in molecular drawings. greglandrum.github.io/rdkit-blog/p...
greglandrum.github.io
Highlight atoms in drawings – RDKit blog
One way to add information to molecular drawings
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Albert Vilella, PhD. @albertvilella.bsky.social · 11/02/2025
Margaret Dayhoff is often called the "Mother of Bioinformatics" because of her pioneering work in computational biology, which began with COMPROTEIN.
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Markus Sitzmann @markussitzmann.bsky.social · 09/02/2025
#cheminformatics
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Markus Sitzmann @markussitzmann.bsky.social · 05/02/2025
BLÖD, wenn man sich gar nicht erinnern kann, wer mit diesem Thema am lautesten gegen die falschen gehetzt hat #BILD
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Barbara Zdrazil @bzdrazil.bsky.social · 05/02/2025
Great work by my fantastic collaborator @slobentanzer.bsky.social and team!
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Markus Sitzmann @markussitzmann.bsky.social · 05/02/2025
For those who don't know the abbreviations (I didn't either): GHG = Greenhouse Gas LULUCF = Land Use, Land Use-Change, and Forestry
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Markus Sitzmann @markussitzmann.bsky.social · 31/01/2025
Nein, liebe #BILD Zeitung, das hat Herr Merz und seine Partei ganz alleine geschafft, da braucht es niemand anderes.
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Reymond Group @reymondgroup.bsky.social · 19/01/2025
🎉Our latest paper "Chemical space as a unifying theme for chemistry" by Jean-Louis Reymond is now published on Journal of Cheminformatics! Read it here👉 jcheminf.biomedcentral.com/articles/10.... #cheminformatics #chemical_space
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ICCS @intconfchemstr.social.edu.nl.ap.brid.gy · 22/01/2025
Hi everyone, the abstract submission deadline (14 February 2025) is nearing. We are very much looking forward to your submissions for oral presentations and posters. #chemistry #cheminformatics #chemsky
Screenshot of a slide with a Call for Papers for the 13th ICCS, June 1-5 2025. It shows 5 main topics (1. Advanced #cheminformatics techniques, 2. Artificial intelligence, machine learning, and QSAR, 3. Integrative Structure-Based Drug Design, 4. New modalities and Large Chemical Data Sets, 5. Open Science, Omics, Natural Products, and a sixth "other" category for superb #cheminformatics research not in the other categories), each with subcategories. They are also found under "Scientific Topics" on the https://iccs-nl.org/ front page
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Noel O'Boyle @baoilleach.bsky.social · 24/01/2025
#cheminformatics #compchem #medchem
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Grouxo March @grouxomarch.bsky.social · 27/01/2025
Fuli Luo: Programming - The Rise of Code Intelligence. DeepSeek-Coder. arxiv.org/pdf/2401.14196 #DeepSeek
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Markus Sitzmann @markussitzmann.bsky.social · 29/01/2025
"EFGs: a complete an accurate implementation of Ertl's functional group (FG) detection algorithm." by Gonzalo Colmenarejo #cheminformatics #chemicalstructure chemrxiv.org/engage/chemr...
chemrxiv.org
EFGs: A Complete and Accurate Implementation of Ertl’s Functional Group Detection Algorithm in RDKit
Functional groups are widely used in Organic Chemistry, as they provide a rationale to analyze physicochemical and reactivity properties. In Medicinal Chemistry they are the basis for analyzing ligand...
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Michael Taffe @effatma.bsky.social · 26/01/2025
This sucks. 😡 #WCBR2025 #WCBR25
Sign indicating the federal employee “communication” ban prevented someone from presenting their work at a scientific meeting.
0276
Markus Sitzmann @markussitzmann.bsky.social · 24/01/2025
#cheminformatics #dataset
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Markus Sitzmann @markussitzmann.bsky.social · 19/01/2025
30+ Jahre altes Kulturgut über 30+ Jahre altes Kulturgut www.youtube.com/watch?v=5Gd-...
youtube.com
Topographie Der Zaun (1995)
YouTube video by Audi80fan
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Peter Greene @palan57.bsky.social · 19/01/2025
AI-fabricated 'junk science' floods Google scholar, researchers warn phys.org/news/2025-01...
phys.org
AI-fabricated 'junk science' floods Google scholar, researchers warn
AI-generated research is a threat, both in terms of society's knowledge and public trust in science. This was the conclusion made by the researchers from the Swedish School of Library and Information ...
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Randall Munroe @xkcd.com · 18/01/2025
Human Altitude xkcd.com/3039
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