iiinova — where your digital self keeps evolving

8/8 🌱 We combine phenotyping, tGBS, association analysis, gene expression data and KASP validation to dissect flowering time in chickpea—and translate genomic information into tools for breeding better-adapted cultivars. #ChickpeaBreeding #PlantBreeding #ClimateResilience

000

7/8 The KASP assays showed 81–90% efficiency in distinguishing early- and late-flowering phenotypes. From a complex phenotype and genomic association… ➡️ candidate genes ➡️ diagnostic SNPs ➡️ practical breeding markers. #MarkerAssistedSelection

100

6/8 🎯 We then translated candidate SNPs into six allele-specific KASP markers and validated them in chickpea germplasm. The goal: markers that can discriminate early- and late-flowering genotypes and become useful tools for breeding. #KASP #MolecularBreeding

5/8 Association is only the beginning. We integrated in-silico gene expression data from floral tissues and the shoot apical meristem to test whether candidate genes were linked to flowering. Genomics + transcriptomics = stronger hypotheses. 🧬🌸 #Transcriptomics

100

4/8 The genetic architecture was complex. We identified flowering-time-associated SNPs across several chromosomes and highlighted candidate genes. Variations in MOS14 and Apyrase 2 explained >86% of phenotypic variance in one population; HisIE accounted for >70% in another. #PlantGenomics

3/8 🧬 We used genotyping-by-sequencing (tGBS) to generate SNP markers across the populations, followed by association analyses to identify genomic regions and candidate genes linked to flowering time. Phenotype → SNPs → candidate genes. #GBS #Bioinformatics

2/8 We analysed four recombinant inbred populations, including intra- and interspecific crosses, to dissect the genetic architecture of days to flowering. Continuous variation suggested polygenic control; a bimodal distribution pointed to a major-effect locus. #PlantGenetics

100

1/8 🌸 Flowering time is key for chickpea adaptation. It determines how plants fit their life cycle to the environment—especially where terminal drought and heat can affect yield. Its genetic basis matters for adaptation. 🌱☀️ #CropScience #ClimateAdaptation

100

From gene discovery to breeding tools: functional KASP markers for flowering time selection in chickpea - BMC Plant Biology

🧵 An amazing work led by A. Carmona,together with our colleagues from IFAPA, N. Gutiérrez and J. Rubio, on how we can go from a complex agronomic trait like flowering time to genetic markers that breeders can actually use. 🌱🧬 Read the paper: link.springer.com/article/10.1... #Genomics #PlantBreeding

link.springer.com

Background Flowering time is a key phenological trait in chickpea (Cicer arietinum L.), determining adaptation to different agro-climatic conditions and directly influencing yield. Here, we investigat...

131

Reposted by Jose V. Die

Manolo Torralbo @manolotorralbo.bsky.social · 11/09/2026

Hoy hemos inaugurado en Granada el curso académico de las universidades andaluzas. Un acto para reivindicar algo esencial: el cumplimiento íntegro del modelo de financiación. Necesitamos una financiación suficiente y estable para seguir construyendo una universidad pública de calidad y con futuro.

023

Reposted by Jose V. Die

Javier Forment @javijevi.bsky.social · 12/09/2026

Si estás cerca de #Avilés este martes 15, puedes venir a la Bienal Climática, donde hablaré del proyecto de ultrasonidos de plantas @puaproject.bsky.social que llevamos un par de años desarrollando junto al cine tivo de artistas @tallerestampa.bsky.social

103

Reposted by Jose V. Die

Universidad de Córdoba @uco.es · 11/09/2026

Financiación suficiente y estable para nuestras universidades. Hoy, desde Granada, las universidades públicas andaluzas reclamamos el cumplimiento íntegro del modelo de financiación para garantizar la sostenibilidad y la calidad de la universidad pública. www.uco.es/servicios/ac...

uco.es

Actualidad Universitaria - La reivindicación del cumplimiento del modelo de financiación protagoniza la apertura del nuevo curso de las universidades andaluzas

El solemne acto de apertura del curso académico 2026/2027 de las universidades andaluzas, que ha tenido lugar en la mañana de hoy en el Hospital Real...

013

Reposted by Jose V. Die

Facultad de Ciencias de la Universidad de Córdoba @cienciasuco.bsky.social · 11/09/2026

🗣️ #BIOTEC2027 se celebrará en Córdoba del 2 al 5 de febrero de 2027, en el Rectorado de la UCO. La XX edición reunirá a especialistas y grupos de investigación en biotecnología. 🔗 sebiot.org/biotec-2027-se-celebrara… #CienciasUCO

Cartel de BIOTEC 2027: Congreso de la Sociedad Española de Biotecnología, del 2 al 5 de febrero de 2027 en el Rectorado de la Universidad de Córdoba.

Biblioteca Universitaria de Córdoba (España) @bibliotecauco.bsky.social · 11/09/2026

Reposted by Jose V. Die

🎓 POV: llegas a la uni y descubres que la biblioteca va a ser tu segundo hogar 📚👀 Jornadas de Acogida Biblioteca de Ciencias del Trabajo. Curso 2026/2027. ¡Bienvenidos/as a vuestra biblioteca! 🙌 #BibliotecaUniversitaria #VidaUniversitaria #BibliotecaUCO

012

Reposted by Jose V. Die

ucocultura @ucocultura.bsky.social · 11/09/2026

¡El Aula de Teatro “Rafael Álvarez El Brujo” de la UCO abre casting! Este año pone en marcha 5 nuevos proyectos teatrales y buscamos personas con ganas de actuar, crear y disfrutar del teatro. 📩 Envía tu solicitud a: aula.de.teatro.uco@gmail.com ¡Te esperamos! @uco.es, @ucocultura.bsky.social

Jose V. Die @jdieramon.bsky.social · 09/09/2026

Reposted by Jose V. Die

Esta primavera se celebraron en Córdoba las IV Jornadas Andaluzas de Bioinformática . Puedes leer la reseña de las #JABI2026 en la newsletter de la @sebibc.bsky.social : www.sebibc.es/portfolio/ne... #bioinformatics @jabi-conference.bsky.social @mvapontes.bsky.social

sebibc.es

Newsletter 2026 – SEBiBC

Jose V. Die @jdieramon.bsky.social · 09/09/2026

sebibc.es

Newsletter 2026 – SEBiBC

Silvia Manrique @tank-silvia.bsky.social · 09/09/2026

Reposted by Jose V. Die

‼️ATENCIÓN‼️ Se han liberado a última hora 3 plazas en el curso de epigenómica de la SEG @segenetica.bsky.social que se celebrará del 13 al 16 de septiembre en La Cristalera (Miraflores de la Sierra, Madrid). Interesades pueden contactarme por aquí o por los canales indicados en la página del curso 👇🏼👇🏼

segenetica.es

Curso Nacional Práctico de Genómica: Epigenómica – Sociedad Española de Genética

014

8️⃣ 📖🚀 Read the full study here: doi.org/10.1186/s128... — and stay tuned as we share more insights from this work in upcoming analyses! Happy to discuss the app, the pipeline, or adapting it to other species! #Fagaceae #ForestGenomics #RShiny #Bioinformatics #OpenScience

doi.org

Client Challenge

010

7️⃣ ✅ Data curation ✅ Structural & phylogenetic analysis ✅ Shiny app development ✅ Open-access deployment. A full pipeline from scattered data → integrated resource → reusable framework. 🚀

100

Protein Database of Fagaceae :

6️⃣ 🎯🚀 Beyond HSP90 itself, the app's modular design offers a flexible framework that can be adapted to build similar tools for other gene families or species of agricultural and forestry interest. Explore it here: hsp90.ext.uco.es

hsp90.ext.uco.es

100

5️⃣ ✅ Previously fragmented data — sequences, structural annotations, phylogenetic relationships — is now integrated into a single, open-source, interactive resource covering 23 #Fagaceae species, from oaks (#Quercus) to chestnuts (#Castanea) and beech (#Fagus).

200

4️⃣ 🧬 The app lets users explore and compare HSP90 protein sequences, annotations, and evolutionary relationships within a gene-family-specific framework — all built on an open bioinformatic pipeline.

100

3️⃣ 🔍 We built HSP90-Fagaceae, an interactive web app developed with R #Shiny that centralizes curated HSP90-related genomic, structural, and phylogenetic data across major Fagaceae species in one place.

100

2️⃣ In our new study we built an answer: Fagaceae species are key players in temperate and Mediterranean forests, increasingly hit by drought and heat under climate change, and HSP90 chaperones are central to that stress response — yet their genomic data had never been centralized

100

1️⃣ 🌳🧬 Where do you go if you need genomic data on heat shock protein 90 (HSP90) across oaks, chestnuts and their relatives — scattered across dozens of databases? #Fagaceae #ForestGenomics #RShiny #Bioinformatics #OpenScience

Facultad de Ciencias de la Universidad de Córdoba @cienciasuco.bsky.social · 31/07/2026

Reposted by Jose V. Die

🗣️ BIOTEC 2027 se celebrará en Córdoba La XX edición del Congreso de la Sociedad Española de Biotecnología tendrá lugar del 2 al 5 de febrero de 2027 en el Rectorado de la @uco.es

001

Jose V. Die @jdieramon.bsky.social · 30/05/2026

@uco.es tenemos la web caída ? Muchas entradas con este error : 1 - Can't create/write to file '/tmp/#sql_5e80_0.MAI' (Errcode: 28 "No space left on device")

000

Reposted by Jose V. Die

Silvia Manrique @tank-silvia.bsky.social · 29/04/2026

Se han terminado las #JABI2026. Enhorabuena @jdieramon.bsky.social, @mvapontes.bsky.social y el resto del equipo organizador de la @uco.es por el éxito! El año que viene toma el relevo Jaén!

061

Reposted by Jose V. Die

Victoria Aguilar-Pontes @mvapontes.bsky.social · 27/04/2026

Arrancamos desde el Rectorado de la Universidad de Córdoba las IV Jornadas Andaluzas de Bioinformática #JABI2026

Mesa de apertura de las JABI2026 con la Vicerrectora María José Polo y el comité organizador en la representación de José Die

031

Reposted by Jose V. Die

Aureliano Bombarely @bombarelya.bsky.social · 27/04/2026

The IV Andalusian Bioinformatics Days (JABI2026) starts with the wonderful introduction by the coordinator Jose V. Die.

041

Reposted by Jose V. Die

Silvia Manrique @tank-silvia.bsky.social · 27/04/2026

Now at #JABI2026: plenary talk by @bombarelya.bsky.social on how to use #bioinformatics to study plant evolution and domestication. @jabi-conference.bsky.social

Aureliano Bombarely standing on stage about to start his talk entitled “Insights about plant evolution and domestication by applying genomics, bioinformatics and AI” at JABI2026 conference.

162

Reposted by Jose V. Die

Jornadas Andaluzas de Bioinformática #JABI2026 @jabi-conference.bsky.social · 27/04/2026

Impresionante la presentación de @bombarelya.bsky.social en las #JABI2026. Rigor por la calidad de los datos y una claridad comunicativa que no dejó a nadie indiferente. ¡Un lujo contar con ponentes así!

064

Reposted by Jose V. Die

Jornadas Andaluzas de Bioinformática #JABI2026 @jabi-conference.bsky.social · 27/04/2026

Quedan inauguradas las #JABI2026 con la vicerrectora de política científica María José Polo y @jdieramon.

042

Reposted by Jose V. Die

Silvia Manrique @tank-silvia.bsky.social · 27/04/2026

Empiezan las @jabi-conference.bsky.social. Inaugura @jdieramon.bsky.social agradeciendo el apoyo de la @uco.es, a los estudiantes voluntarios y dando la bienvenida a todos los participantes. Vamos a ello! #JABI2026

El profesor José V. Die dando una charla de bienvenida a las Jornadas Andaluzas de Bioinformática (JABI2026) , acompañado por la vicerrectora de política científica de la Universidad de Córdoba, María José Polo Gómez, en el salón de actos del edificio de rectorado de la UCO.

042

Jose V. Die @jdieramon.bsky.social · 04/04/2026

Flat Earthers have virtually disappeared from mainstream media coverage this week. Tough times for those who built careers profiting from — and actively contributing to — public ignorance.

000

Reposted by Jose V. Die

Manolo Torralbo @manolotorralbo.bsky.social · 04/04/2026

🎓 El próximo martes 7 de abril quiero presentaros al equipo que me acompañará en esta nueva etapa al frente de la @uco.es Os esperamos en el patio central del Aulario Averroes de Rabanales a partir de las 10:30, para compartir este momento y debatir juntos sobre el futuro de la UCO ¡Nos vemos allí!

088

Reposted by Jose V. Die

Jornadas Andaluzas de Bioinformática #JABI2026 @jabi-conference.bsky.social · 27/03/2026

🎉 Nuevo patrocinador confirmado La Sociedad Española de Bioinformática y Biología Computacional (SEBiBC, bsky.app/profile/sebi...) se suma como patrocinador de uno de los premios de las #JABI2026. Agradecemos su colaboración y su apuesta por impulsar la comunidad bioinformática.