Sign in

Matti Ruuskanen

@begia.bsky.social
78 followers 65 following 14 posts

PhD, University Lecturer at U. of Turku, Adjunct Prof. (docent) at U. of Helsinki | Research in human microbiomes, health and food, bioinformatics & data science | Musician, partner dancing and outdoors enthusiast

PostsRepliesMedia
Reposted by Matti Ruuskanen
Michael Baym @baym.lol · 01/08/2026
What a title!
1142
Matti Ruuskanen @begia.bsky.social · 26/05/2026
Ensimmäinen johtamani tutkimushanke, "Suolistomikrobiston kasviperäisten ruokien metabolian genomipohjainen mallintaminen" on saanut rahoituksen Sakari Alhopuron Säätiöltä! Suuret kiitokset tuesta! www.sakarialhopuronsaatio.fi/apurahat/myo...
sakarialhopuronsaatio.fi
Myönnetyt apurahat
2691
Matti Ruuskanen @begia.bsky.social · 27/03/2026
I have been tempted, but luckily haven't really committed yet to trying full-on AI-assisted data analysis. Better safe than sorry! The current best approach might be to only consult LLMs when solving specific issues in your own code.
010
Matti Ruuskanen @begia.bsky.social · 09/12/2025
Our new paper on allergies and skin microbiomes is now out! Thanks for the informative video, @microbiologysociety.org !
010
Matti Ruuskanen @begia.bsky.social · 09/10/2025
Our new systematic review is now out! Briefly, temporal multi-omic data and analyses are crucially needed to improve our understanding of microbiomes. Also, often the omics layers are not analyzed in an integrative way, even while such methods exist. academic.oup.com/bib/article/...
academic.oup.com
Multi-omics time-series analysis in microbiome research: a systematic review
Abstract. Recent developments in data generation have opened up unprecedented insights into living systems. It has been recognized that integrating and cha
041
Matti Ruuskanen @begia.bsky.social · 02/07/2025
www.nature.com/articles/s41... Our new paper on the risks and socio-demographic dimensions of antibiotic resistance in the human gut is now out in @natcomms.nature.com!
nature.com
Variation and prognostic potential of the gut antibiotic resistome in the FINRISK 2002 cohort - Nature Communications
Here, in a representative cohort of 7,095 Finnish adults, the authors reveal that gut antibiotic resistance is shaped not only by antibiotic use but also by the microbiome, diet, lifestyle, household ...
0106
Reposted by Matti Ruuskanen
infogut.bsky.social @infogut.bsky.social · 26/05/2025
🚨#infogut2025 The 1st INFOGUT COST Action meeting is taking place at the University of Bologna! We’re thrilled to come together to discuss the latest advancements in *in vitro colon models* simulating gut microbiota-mediated interactions #COSTAction #GutMicrobiota #InVitroModels #MicrobiomeResearch
283
Matti Ruuskanen @begia.bsky.social · 17/01/2025
Kaipa se on nyt virallista, kun allekirjotin työsopparinki 😎 Aloitan toukokuun alusta yliopistonlehtorina Bioteknologian laitoksella Turun yliopistossa! Tulevat opetushommat on varmasti antoisia, mutta nyt voin aloittaa myös oman tutkimusryhmän perustamisen, jos rahoituksen tuulet on suotuisia 🤞
020
Matti Ruuskanen @begia.bsky.social · 20/12/2023
Päivystys alkakoon! www.helsinki.fi/fi/tutustu-m...
030
Matti Ruuskanen @begia.bsky.social · 01/12/2023
Vaikka tagit ei niin hyvin toimi bskyssä, niin: #MinäTutkin ihmisten suolisto- ja ihomikrobistojen vaikutuksia kroonisiin sairauksiin, kuten 2-tyypin diabetekseen ja allergioihin. Lisäksi kehitän ja sovellan mm. koneoppivia mallinnusmenetelmiä mikrobistodatassa.
180
Matti Ruuskanen @begia.bsky.social · 29/11/2023
Ohoh, seuraajia! Tarkoituksena keskustella lähinnä töistäni eli mikrobiologiasta suomeksi ja englanniksi. X (formerly known as Twitter) alkoi kovasti tökkiä omistajanvaihdoksen jälkeen. En lupaa olla julkaisematta sisältöä mm. pyöräilystä, musiikista, ympäristöstä, ja ehkä jopa politiikasta.
040