Sign in

January Weiner

@january3.github.io
772 followers 1.1K following 2.7K posts

Bioinformatician, biostatistician, science writer. About me: january3.github.io All my photographs are completely free to use, public domain and CC0. Blog o naukowych różnościach: january3.github.io/biokompost

PostsRepliesMedia
Reposted by January Weiner
Zach Weinersmith @zachweinersmith.bsky.social · 28/09/2026
"Stop going to bat for Elon." I literally have a book about how his Mars ideas are unworkable. It took years! I just don't understand this thread of thought were you see a capability and say it isn't real. I've seen people comparing Starship to the DC-X to prove nothing new is happening.
1434916
January Weiner @january3.github.io · 27/09/2026
ja się już dawno przyzwyczaiłem do dodawania słowa "ptak" :)
211
January Weiner @january3.github.io · 26/09/2026
a bo z Brexitem albo Trumpen było inaczej?
070
January Weiner @january3.github.io · 26/09/2026
jak go spytałem o "remigrację" to odpowiedział że to przecież nie o niego chodzi, tylko o nierobów i bandytów, a on przecież jest porządny i podatki płaci
1110
January Weiner @january3.github.io · 26/09/2026
stary, ja niedawno jechałem taksówką z kierowcą - starszawym Turkiem z Anatolii, który łamanym niemieckim namawiał mnie do głosowania na AfD
1100
January Weiner @january3.github.io · 25/09/2026
wow, and you didn't even use #rlang! (which would probably be my instinct when trying to implement something like this)
100
January Weiner @january3.github.io · 23/09/2026
tak to też zrozumiałem :)
011
January Weiner @january3.github.io · 23/09/2026
(I finally re-did it in #typst, though)
2111
January Weiner @january3.github.io · 23/09/2026
oczywiście, przecież o tym mówię. dlatego na narzekanie że ojej ojej obcięli zasięgi teatrowi bo sztuka lewacka mogę tylko wzruszyć ramionami. Kto płaci fejsowi, ten go wspiera.
020
January Weiner @january3.github.io · 23/09/2026
ale i tak nie żal mi żadnego klienta fejsa, który został ocenzurowany przez fejsa w 2026 (klient fejsa: ktoś, kto płaci fejsowi za robienie zasięgów celem reklamy, wyrabiania marki lub innego sposobu zarabiania pieniędzy). Idziesz na melinę to nie pytaj czy kieliszki są miarowane.
000
January Weiner @january3.github.io · 23/09/2026
LOL, I rest my case
000
January Weiner @january3.github.io · 23/09/2026
oczywiście, przecież to jest zwykły państwowy faszyzm.
110
January Weiner @january3.github.io · 23/09/2026
a to inna sprawa
100
January Weiner @january3.github.io · 23/09/2026
wsadzano przecież za druk i kolportowanie, a nawet posiadanie bibuły, nie tylko w stanie wojennym.
100
January Weiner @january3.github.io · 23/09/2026
Niemniej jednak wolę być w mniejszym towarzystwie na bsky niż iść do pierdla.
210
January Weiner @january3.github.io · 23/09/2026
kto narzekał? Nie wiem czy słyszałeś o Karcie 77 i The Plastic People of the Universe (którzy poszli do pierdla za śpiewanie Když je dnes člověku dvacet, chce se mu hnusem zvracet itp). Tak że weź mnie nie rozśmieszaj, bo mam zajady. Całe mnóstwo nie-artystów szło siedzieć za krytykę cenzury.
100
January Weiner @january3.github.io · 23/09/2026
Dlatego pisałem, że wtedy przynajmniej sytuacja była w miare jasna. Dlatego należy się domagać transparentności, wymuszać otwartość protokołów, zasady fair play etc etc, więc pisanie że to "cenzura jak za komuny" to gorzej niż niemądre uproszczenie, to strategiczny błąd.
100
January Weiner @january3.github.io · 23/09/2026
...ale nie zmienia faktu, że to nie jest "cenzura jak za komuny".
100
January Weiner @january3.github.io · 23/09/2026
pewnie dlatego na cenzurę mety narzekają głównie ci, którzy używają socjali do celów zarobkowych (bo tylko ich interesują zasięgi). Ja to widzę tak: oni są klientami mety i od niej kupują towar, czyli takich jak ja. Słusznie oburzają się na monopolistyczne praktyki...
100
January Weiner @january3.github.io · 22/09/2026
Bo bot mety może wtedy odpowiedzieć to co ja odpowiedziałem, i koniec rozmowy.
000
January Weiner @january3.github.io · 22/09/2026
Co nie zmienia faktu, że triggerują mnie takie porównania. Bo nie chodzi o to, że "za komuny było gorzej", tylko że mechanizmy były inne, w pewnym sensie sytuacja była jaśniejsza. Jak przyrównujesz cenzurę meta do cenzury komuny, to utrudniasz walkę z metą i innymi monopolistami.
110
January Weiner @january3.github.io · 22/09/2026
Also, "monopolizacja skazuje na korzystanie z meta", napisał @slwstr.bsky.social na bluesky. Wiesz, ja się generalnie zgadzam że praktyki meta &co są nie tylko nie fair, ale przede wszystkim niebezpieczne; social media to zasób krytyczny i powinny być kontrolowane i regulowane jak inne takie zasoby.
210
January Weiner @january3.github.io · 22/09/2026
oczywiście. Ale ciężko ją porównywać z cenzurą za komuny. Ew. prędzej z "miękką" cenzurą polegającą na tym, że pewne książki wydawano w bardzo niewielkiej liczbie egzemplarzy, albo ograniczano dystrybucję.
000
January Weiner @january3.github.io · 22/09/2026
(raczej "kiedy przyjdzie" a nie "jak przyjdzie")
010
January Weiner @january3.github.io · 22/09/2026
och, za to że puścisz taką reklamę gdzieś indziej to nie pójdziesz do pierdla, also jak będziesz ją chciał zobaczyć to bez problemu ją znajdziesz, zupełnie legalnie. Ja bym nie szafował takimi porównaniami, bo jak naprawdę przyjdzie cenzura, to nam ich zabraknie.
320
January Weiner @january3.github.io · 22/09/2026
(reporting is one of these things that I would love to delegate to LLMs as I am sure that these reports are at best read by LLMs only, but more likely no one ever reads them)
010
January Weiner @january3.github.io · 22/09/2026
OK, the entries were very, very good; but there were individual names here and there that were incorrect. It was Jan. last year AFAIK and I can't find the conversation any more. I found a conversation from *this* year, however, doing a similar thing, and there are no errors I can find right now.
110
January Weiner @january3.github.io · 21/09/2026
I once tried to use an LLM to fill out missing information from BibTeX files - google scholar is notorious in cutting short the list of authors. Not for a paper, of course, but for a lit summary for reporting. The result was full of hard to spot errors, "hallucinations".
120
January Weiner @january3.github.io · 17/09/2026
Two factorial experiment are abundant in the medical research at least. It is typical for mouse experiments: two strains of mouse, treated vs control. Or in the case of clinical trials: two time points, treated vs control. Was the change in treated patients different from the change in the control?
010
January Weiner @january3.github.io · 17/09/2026
Out of interest, a question: so you did not publish the data because you hoped to get another paper out of it. And, did you? get another paper out of it? Did you publish the data eventually?
000
January Weiner @january3.github.io · 17/09/2026
Actually, it is fairly common, I see it all the time in the wild. Any two-factorial experiment invites this type of thinking. It is linked to a fundamental misunderstanding of the asymmetry in a statistical test. See sites.stat.columbia.edu/gelman/resea...
sites.stat.columbia.edu
110
January Weiner @january3.github.io · 16/09/2026
As it is now, it is impossible to replicate even the analyses in most of the papers you find out there. (Same goes for experiments, actually: elifesciences.org/articles/67995)
elifesciences.org
Reproducibility in Cancer Biology: Challenges for assessing replicability in preclinical cancer biology
A project to repeat experiments from high-impact papers in cancer biology encountered a series of challenges, many of which were caused by a lack of detail in the original papers.
000
January Weiner @january3.github.io · 16/09/2026
Or you don't have patients consent to publish, say, raw RNA-Seq reads. But there are ways around even that, and not publishing data AND CODE should be a rare, frowned upon exception, and not the rule as it is today.
200
January Weiner @january3.github.io · 16/09/2026
more than that. You need a *public* paper trail. And yet it is often hard to convince scientists to even publish their data.
110
January Weiner @january3.github.io · 16/09/2026
how would you qualify slapping "exploratory" on each set of comparisons which are too weak to be significant after applying Benjamini-Hochberg :-D
101
January Weiner @january3.github.io · 16/09/2026
Exactly. So it is not only hard to prove, it is also hard to "raise suspicion". I have the impression that only the most clear, most blatant and stupid frauds are ever even suspected, like cut & paste of gel images or generating random numbers that have a different distribution than real world data.
100
January Weiner @january3.github.io · 16/09/2026
I am not so sure about fraud being rare. The cases of fraud that I find on retraction watch and elsewhere are so blatant, so obvious, so... ignorant and stupid - I wonder whether detecting fraud done by someone who thought about it for more than 2 minutes can be detected at all.
040
January Weiner @january3.github.io · 16/09/2026
you, sir, are overly optimistic with regards to statistical skills of the scientists.
010
January Weiner @january3.github.io · 16/09/2026
However, you cannot refute their conclusions based on something that was not done. You would have to redo their analysis correctly, and even then, if the test was not significant, it would not necessarily overturn the conclusion - it would not falsify their hypothesis, just weaken it.
000
January Weiner @january3.github.io · 16/09/2026
Regarding #3, here is a recent example (this paper: pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/42120725/) - at one point they compare significant with non-significant (i.e. comparison significant in one group but not the other) and draw conclusions. This is incorrect, they should have run an interaction test.
100
January Weiner @january3.github.io · 16/09/2026
I have a similar paper showing also a substantial percentage among the papers that could make this mistake: doi.org/10.3389/fgen...
doi.org
Frontiers | Venn Diagrams May Indicate Erroneous Statistical Reasoning in Transcriptomics
A common application of differential expression analysis is finding genes that are differentially expressed upon treatment in only one out of several groups ...
050
January Weiner @january3.github.io · 16/09/2026
You probably know the famous "erroneous interaction analysis" paper showing that 50% of the papers that could make a mistake, did it: doi.org/10.1038/nn.2...
doi.org
Erroneous analyses of interactions in neuroscience: a problem of significance - Nature Neuroscience
The authors analyze a large corpus of the neuroscience literature and demonstrate that nearly half of the published studies considered incorrectly compared effect sizes by comparing their significance...
2201
January Weiner @january3.github.io · 16/09/2026
1) hard to detect looking at a single paper only and not scrutinizing supplementary data or doing extensive image searches 2) 50-90% 3) very hard to show. The problem is that papers try to "prove" a conclusion, lacking an experiment trying to disprove it. 4) frequent but often harmless
371
January Weiner @january3.github.io · 16/09/2026
OK I understand but. The column name was not in the kindly provided data dictionary and read "IdPrel". I thought "preliminary ID"? Turns out the data is from Quebec and it was actually ID prélèvement - sample ID... Seems obvious in hindsight. Also, vcode was not visit code but code volet. *sigh*
010
January Weiner @january3.github.io · 16/09/2026
raczej próba dominacji nad lekarzami :)
030
January Weiner @january3.github.io · 16/09/2026
och ja wiem co on myśli, ale nie wiem, co ja o tym myślę
010
January Weiner @january3.github.io · 15/09/2026
well, can relate, I like math, but I do like science better
010
January Weiner @january3.github.io · 15/09/2026
Dziś na wideokonferencji powiedziałem do lekarzy że jestem biologiem, na co fizyk poprawił mnie i powiedział że nie biologiem, tylko matematykiem. Sam nie wiem co o tym myśleć
260
January Weiner @january3.github.io · 15/09/2026
tak się wydaje, a potem nagle masz pięćdziesiątkę z hakiem i jak wstajesz to zastanawiasz się czy ci się uda wyprostować
130
January Weiner @january3.github.io · 15/09/2026
Najbardziej żałuję że przez cały ten czas w NRW nie odwiedziłem nigdy doliny nazwanej od nazwiska prostestanckiego teologa i kompozytora, Joachima Neandera. Jest to niby kawałek z Münster, ale w Kolonii jakoś bywałem.
030