Em 2024, Mujica foi diagnosticado com câncer de esôfago. "Até aqui cheguei", disse à época. Ele reduziu sua agenda pública e passou os últimos meses ao lado de sua esposa, a senadora Lucía Topolansky, em sua chácara de Rincón del Cerro – onde será enterrado junto de Manuela, sua finada cadelinha.